Низшей единицей административной организации было отделение ("хан"), в которое сводились нижние чины, питающиеся из одного бачка. Несколько отделений сводились в дивизион ("бунтай") под командованием офицера. Каждая боевая часть корабля имела в своём составе как минимум один дивизион. Один или несколько дивизионов офицеров и нижних чинов одной специальности образовывали боевую часть ("ка"). Кроме авиационной БЧ в состав авиагруппы обычно входили также боевые части: связи, авиатехническая, медицинская, снабжения. Во главе авиагруппы стояли командир и его заместитель. При этом эти офицеры могли не быть авиаторами, и тогда старшим авиатором в авиагруппе был командир авиационной боевой части ("хико:сё").
Особенностью организации авиационной БЧ было то, что все самолёты одного класса (т.е. все истребители, все пикировщики и т.п.) в ней сводились в авиационный отряд ("хико:тай")[* Исключение, скорее всего, делалось для вспомогательных самолётов (транспортных или самолётов-разведчиков, предназначавшихся для лидирования истребителей) в боевых авиагруппах. Их личный состав сводился в отдельный дивизион, но своего авиаотряда не имел. Впрочем, иногда самолёты одного класса могли сводиться в несколько хико:таев.], служивший связующим звеном между административной и тактической организацией. С одной стороны, командиру хико:тая подчинялись административные дивизионы, с другой стороны, будучи старшим летающим офицером (командир авиационной БЧ в воздух обычно не поднимался), он вёл в бой тактические эскадрильи.
В марте 1944 г. административная организация авиагрупп была изменена. Теперь они состояли из отдельных (т.н. "специальных") авиаотрядов, получивших сквозную нумерацию (по классам самолётов) во всей авиации флота. Такая организация приближала административную организацию к тактической (теперь дивизион соответствовал эскадрилье) и способствовала повышению мобильности авиачастей.
С целью дополнительного повышения мобильности в июле 1944 г.[** Первая аэродромная часть была создана в Китае ещё в феврале, но массовое их создание началось в июле.] лётные подразделения авиачастей были отделены от подразделений наземного обслуживания. Последние были сведены в аэродромные части (т.н. "авиагруппы Б"), каждая из которых отвечала за обслуживание самолётов на аэродромах достаточно крупного района (например, все флотские аэродромы на острове Формоза (Тайвань) до июня 1945 г. обслуживала только одна такая часть).
Низшей тактической единицей был самолёт ("хикожи"). При этом командиром многоместного самолёта (а также звена и эскадрильи) мог быть не только пилот, но и лётчик-наблюдатель. 3 самолёта сводились в звено ("сё:тай"), 2-3 звена сводились в эскадрилью ("тю:тай"), а 2-3 эскадрильи — в отряд ("дайтай"). Специальных командирских звеньев не полагалось, и командир эскадрильи, например, кроме самой эскадрильи также командовал первым её звеном и первым самолётом звена. Особенностью японской морской авиации было малое число офицерского состава — офицеры составляли только порядка 1/10 от общей численности лётного состава.
Стандартная тактическая организация истребительных и бомбардировочных авиагрупп была троичной (3 самолёта в звене, 3 звена в эскадрилье и 3 эскадрильи в отряде).
В начале 1944 г. стандартная тактическая организация истребительной и истребительно-бомбардировочной авиации была изменена. Теперь 2 самолёта сводились в пару ("хэнтай"), 2 пары — в четвёрку ("ку:тай"), 2 четвёрки — в звено, 2 звена — в эскадрилью и 2 эскадрильи — в отряд. Следует отметить, что фактически двоичная организация периодически применялась в некоторых частях как минимум с 1941 г.
Следует отметить, что организация авиагруппы при выполнении конкретного боевого вылета отнюдь не была жёстко привязана ни к стандартной тактической организации, ни к организации административной. Поэтому периодически встречающиеся попытки однозначно приравнять дивизион к эскадрилье неверны. Возможно, так первоначально задумывалось, но на практике как минимум с 1941 г. можно увидеть 3 дивизиона, формирующие 2 эскадрильи, или эскадрилью, сформированную из личного состава 2 дивизионов. Только с 1944 г. дивизион стал соответствовать эскадрилье (по крайней мере, по штатной организации).
