В целях поддержания банковской ликвидности Центральный банк активно использовал такие инструменты рефинансирования, как ломбардные кредиты, которые предоставлялись под залог государственных ценных бумаг. В августе-сентябре 1998 года Центральный банк выдал ломбардные кредиты 80 банкам 19 регионов Российской Федерации на общую сумму 14,9 млрд. рублей. В период с 1 августа 1998 года по 1 марта 1999 года Центральный банк предоставил беззалоговые однодневные кредиты ("овернайт") 34 банкам на общую сумму 65,7 млрд. рублей. С августа 1998 г. по март 1999 г. в соответствии с решением Совета директоров Центральный банк предоставил под залог акций заемщиков "стабилизационные кредиты" на срок до 1 года 15 банкам на общую сумму 17,8 млрд. руб.
Очень многое в той ситуации зависело не только от Центрального банка, но и от владельцев (акционеров) кредитных организаций, их заинтересованности покрыть образовавшиеся от обесценения ГКО-ОФЗ и девальвации рубля убытки за счет прибыли от других коммерческих проектов. Так, например, поступили акционеры "Газпромбанка" и "Альфа-банка", которым удалось во время трехмесячного моратория на выплату задолженности перед банками-нерезидентами, реструктурировать активы и отвести свои банки от опасной черты банкротства. "Альфа-банк" первым из крупных российских банков договорился с западными кредиторами о реструктуризации своего долга на сумму $77 млн.
Безучастное отношение владельцев (акционеров) банков к проблемам, которые они испытывали, как правило, заканчивалось плачевно. Самый яркий пример — банкротство банка "Империал", акционерами которого являлись далеко не самые бедные российские компании: "Газпром", "ЛУКОЙЛ" и "Зарубежнефть". До кризиса 1998 года "Империал" входил в десятку крупнейших российских банков. В середине 1990-х годов получила известность серия его рекламных телевизионных роликов "Всемирная история банка "Империал"". По данным СМИ, "ЛУКОЙЛ" запаздывал с возвращением "Империалу" кредита на сумму 33 млн. долларов США. 13 августа 1998 года (за 4 дня до объявления дефолта) "ЛУКОЙЛ" переоформил свою задолженность банку в векселя на 161 млн. 904,2 тыс. руб. (со сроком погашения через 3 года) и на 379 млн. 414 тыс. руб. (сроком на 15 лет). И банк рухнул. 25 августа 1998 года Центральный банк отозвал у "Империала" банковскую лицензию "в связи с неисполнением требований федеральных законов… и нормативных актов Банка России, установлением фактов недостоверности отчетных данных, учитывая неоднократное применение мер в порядке надзора".
До сих пор в банковском сообществе и среди финансовых журналистов не затихают споры о причинах банкротства "СБС-Агро" и "Инкомбанка" — банков общефедерального значения. Первый обслуживал кредиты и финансовые потоки агропромышленного комплекса страны. Второй — являлся ядром финансово-промышленной группы, которой принадлежало 20 % акций предприятий химической и нефтехимической промышленности, 17 % — транспортных организаций, 16 % — пищевой промышленности, 15 % — предприятий связи, 14 % — машиностроения, 11,5 % — черной и цветной металлургии, 9 % — энергетики. Много слухов и толков вызывали личности руководителей этих банков: А.П.Смоленского и В.В.Виноградова.
3 сентября 1998 г. Центральный банк объявил о введении в "СБС-Агро" временной администрации и отстранении от управления банком прежнего руководства. Дальше стали происходить фантастические вещи. 10 сентября 1998 г. на основании решения Элистинского городского суда Республики Калмыкия работа временной администрации "СБС-Агро" сначала была приостановлена, а затем прекращена. С 21 сентября все отделения банка снова приступили к работе, а 2 октября Совет директоров Центрального банка принял решение о предоставлении "СБС-Агро" "стабилизационного" кредита в размере 7,4 млрд. руб. (выдано было 5,86 млрд. руб.) под залог пакета "замороженных" государственных ценных бумаг. И еще целый год "СБС-Агро" будет присутствовать на рынке: выдавать кредиты сельскохозяйственным товаропроизводителям, проводить клиентские платежи, расплачиваться со старыми вкладчиками и привлекать новых клиентов, но и при этом, не возвращая свои долги вкладчикам и банкам-нерезидентам.
Временная администрация вернется в "СБС-Агро" только через год, в августе 1999 г. Ее возглавит зампред Центрального банка Г.И.Лунтовский, а в ноябре того же года "СБС-Агро" перейдет под управление Агентства по реструктуризации кредитных организаций (АРКО), которое обнаружит утрату банком своих основных активов. Руководителю АРКО А.В.Турбанову останется только вздохнуть: "Не СБС банкротить надо, а Смоленского…" 17 мая 2000 года прокуратура ЦАО Москвы возбудит уголовное дело в отношении руководителей "СБС-Агро" по статьям 160 и 201 УК РФ. В материалах уголовного дела, которое, так, по сути, ничем и не закончится, следователи напишут: "Руководство банка, злоупотребляя своими полномочиями, использовало полученные от Банка России кредиты не по целевому назначению, обналичив и присвоив большую часть денежных средств".