15 марта 1920 г. Дзержинский и начальник войск Валобуев подписали инструкцию, в которой указывалось, что эти батальоны подчиняются ЧК. Командиры батальонов в отношении военно-строевого обучения, проверки несения караульной службы, хозяйственной и политической работы, а также во всех остальных отношениях непосредственно подчиняются председателю ЧК или лицу, уполномоченному на это коллегией ЧК[285].
Выполняя решения IV Всероссийской конференции, Дзержинский и Менжинский 7 апреля 1920 г. издали приказ об организационных изменениях в особых отделах в связи с разгромом основных сил военной контрреволюции и неприятельского шпионажа.
Учитывая результаты «успешной борьбы с контрреволюцией в войсках и шпионажем, наличие войсковых частей, крупных заводов и фабрик, работающих на оборону и на воссоздание транспорта, важность железнодорожных и водных путей и что в некоторых местах задачи особых отделов могут быть выполнены при посредстве уполномоченных по борьбе с контрреволюцией в войсках и шпионажем при секретно-оперативных отделах губчека и при политбюро уездных городов», руководители ВЧК решили ввести отдельные штаты для особых отделов Московской и Петроградской губЧК; расформировать особые отделы губчека: Костромской, Владимирской, Рязанской, Тамбовской, Калужской, Курской, Симбирской, Тверской, Брянской, Иваново-Вознесенской, Екатериненштадтской (области немцев Поволжья), Череповецкой, передав их функции уполномоченным при секретно-оперативных отделах губчека; в то же время организовать особые отделы (с нормальными штатами) губчека в Архангельской, Олонецкой, Казанской и Астраханской, поручив это соответствующим начальникам особых отделов армий[286].
21 апреля 1920 г. постановлением СТО для успешного выполнения задач, возложенных на войска ВОХР, все войска, имевшие назначением охраны и поддержания порядка и обеспечением выполнения распоряжений правительства (караульные, железнодорожной милиции и др.), как на фронте, так и в тылу объединены с войсками ВОХР в один общий вид внутренней службы[287].
Но особое внимание Дзержинский обратил на Украину.
Во время войны с Польшей в 1920 г. председатель ВЧК говорил и о работе ЧК, которая, по его оценке, «значительно усовершенствовалась», но крайне важно «единство руководства борьбой всех местных комиссий». Для этого необходим аппарат, которого до сих пор не было, создать Секретно-оперативный отдел, в первую очередь (в отличие от России) «поставить разведку в деревне, без этого военный разгон банд является вредной операцией, ибо бандиты разгоняются и не приставшее к ним население восстанавливается против нас»[288].
Ф.Э. Дзержинский часто советовался по этому вопросу с И.К. Ксенофонтовым. Его письма очень откровенные и заслуживают того, чтобы привести некоторые из них полностью хотя бы потому, что они, по существу, показывают в полном объеме работу ВЧК в условиях военного времени на Украине.