Начало переходного периода связано со вступлением в силу Маастрихтского договора 1992 г., согласно которому направления сотрудничества, составляющие ПСБП, были в основном включены в компетенцию ЕС в виде автономных сфер сотрудничества в рамках ст. 100 с Договора, устанавливающего Европейское сообщество, и ст. К. Договора о Европейском союзе. Частью права Сообществ, известного в доктрине как первая опора права ЕС, стала только визовая политика. Все остальные вопросы (контроль на границах, иммиграционная политика и предоставление убежища, судебное сотрудничество по гражданским делам, судебное и полицейского сотрудничество по уголовным делам) были закреплены в ст. К(Раздел VI) Договора о ЕС, которая в качестве правовых инструментов предусматривала разработку международных конвенций, общих действий и совместных позиций, не обладающих прямым действием и принимаемых Советом ЕС единогласно, при этом право законодательной инициативы в большинстве случаев принадлежало государствам. Суд ЕС не имел компетенции в этой сфере, а роль Европарламента была номинальной.
Вступление в силу Амстердамского договора 1 мая 1999 г стало отправной точкой развития третьего (после внутреннего рынка и ЭВС) масштабного проекта ЕС – построения Пространства свободы, безопасности и правосудия.
С заключением Амстердамского договора структура сотрудничества в сфере ПСБП стала более сложной. Механизм углубленного сотрудничества, установленный ст. К.7, развился в отдельный институт продвинутого сотрудничества в рамках Раздела VII Договора о ЕС. Как указано в ст. 40, продвинутое сотрудничество в какой-либо из предусмотренных Разделом VI областей призвано дать возможность Союзу быстрее создать ПСБП.
Ст. 100с Договора, устанавливающего Европейское сообщество, стала в редакции Амстердамского договора Разделом IV, в который были перенесены из третьей опоры иммиграционная политика, предоставление убежища и сотрудничество судов по гражданским делам в дополнение к визовой политике, а инкорпорация Шенгенского сотрудничества позволила дополнить сферу регулирования Раздела IV вопросами пограничного сотрудничества.
Включение приведенных вопросов в Раздел IV Договора о Сообществе означало придание им статуса
Раздел VI Договора о ЕС претерпел значительные изменения в соответствии с Амстердамским договором. Из него были исключены и перенесены в первую опору все вопросы, за исключением полицейского и судебного сотрудничества по уголовным делам. В то же время оставшиеся в третьей опоре сферы сотрудничества получили более детальное регулирование и более эффективные правовые инструменты. Помимо имевшихся в редакции 1992 года общих позиций, совместных действий и конвенций, были добавлены два новых инструмента – рамочные решения и решения, которые не обладали прямым действием. Рамочные решения должны были применяться только в целях сближения законодательства государств и были обязательны в отношении конечного результата. Решения имели обязательную силу и применялись по всем остальным вопросам Раздела VI.
Протокол об интеграции шенгенских достижений в правовую систему Европейского союза, приложенный к Амстердамскому договору, юридически оформил инкорпорацию Шенгенского сотрудничества в правовую систему ЕС. Фактически же частичная инкорпорация произошла еще в 1992 г., когда в рамках права Сообществ получили регулирование вопросы визовой политики, а в рамках созданной третьей опоры ЕС были объединены вопросы борьбы с преступностью, иммиграции, предоставления убежища и таможенного сотрудничества.
В соответствии с Договором Ниццы 2000 г. было расширено применение процедуры совместного принятия решений в рамках Раздела IV Договора о Сообществе и институционализирована роль Евроюста и Европола в Разделе VI Договора о ЕС.
Современный этап развития ПСБП связан с заключением в 2007 г. Лиссабонского договора о реформировании Европейского союза[132], который вступил в силу 1 декабря 2009 г. после завершения национальных процедур во всех государствах ЕС.
