Несмотря на понятный всем исход войны конструкторы фирмы продолжали работу над новой модификацией штурмовика, которая должна была бы заменить B-2VB-3. Это был штурмовик С-1, который должен быть вооружен сдвоенной пушкой МК 103 в подфюзеляжной гондоле. На каждую пушку предполагалось иметь по 60 снарядов (в отличие от 30 на МК 101/103 (В-2)). Хотя конечно пилот мог только достаточно ограниченно наводить пушки на цель, рыская по курсу. Кроме того, предполагалось оставить два курсовых пулемета MG 17, а также поставить пару пулеметов для прикрытия задней полусферы. Для стрельбы предполагалось поставить прицел заднего вида Revi 5.
Такая конструкция была опробована на стандартном Hs 129 В-2 (W.Nr. 0224. DE+ZR) в Тарневице в 1943 году. Первоначальными планами предусматривалось не только изменение вооружения и самого «сердца самолета» – двигателя. По прежнему надежного германского двигателя не было, поэтому планировали поставить итальянский 12-цилиндровый Isolta-Fraschini «Della» мощностью 1200 л.с.
Хотя на тот момент с двигателем существовали некоторые проблемы, но итальянцы обещали быстро их решить. Однако выход Италии из войны 3 сентября 1943 года поставил крест на всей программе. Поэтому было решено остановиться на модернизированном все том же «Гном-Рои» RI4 М38 мощностью 820 л.с. По планам конструкторов установка такого двигателя могла добавить 50 км\ч к скорости самолета (по сравнению с В-2).
Однако и взлетный вес возрос на 200 кг. Тем не менее, в августе 1943 года работы по установке таких двигателей провели на В-2 (W.Nr. 0267, DQ+ZC). Но летчики – испытатели выявили на самолете ряд серьезных проблем, мало того в сентябре самолет столкнулся с Ju 88 и был поврежден. Его отремонтировали, но в практически сразу возникли серьезные проблемы с карбюратором.