Вскоре в Латвию прибыла комиссия Президиума ЦК КПСС. Началась своего рода «охота на ведьм»: на собраниях в руководящих органах Латвии выявляли «буржуазных националистов». Были сняты со своих постов многие коммунисты, которые вступили в партию еще в подполье, во времена буржуазной Латвии. Возможно, что если бы не ошибки 1959 года, то национальный вопрос не стоял бы теперь в Латвии так остро.
В начале 1960 года состоялся очередной пленум ЦK КПСС, который внес важные изменения в руководство партии. Полноправными членами Президиума ЦК КПСС стали А. Н. Косыгин, Н. В. Подгорный и Д. С. Полянский. Из состава Президиума, Секретариата и из ЦК КПСС был выведен А. И. Кириченко. Он вошел в Президиум ЦК в 1955 году и стал здесь активным сторонником Хрущева. Хотя Кириченко имел репутацию не только грубого, но и во многих отношениях невежественного человека, он пользовался тогда полным доверием и расположением Хрущева. В Секретариате ЦК именно он стал вскоре после июньского пленума 1957 года вторым человеком и обычно председательствовал на заседаниях Секретариата и Президиума ЦК во время продолжительных поездок Хрущева по стране и за границу. С другими членами партийного руководства Кириченко держался крайне грубо и нередко злоупотреблял властью. Инспектируя однажды южные области Украины, он оборудовал под свою резиденцию большой теплоход, превратив служебную поездку в увеселительную экскурсию. Члены Президиума ЦК предприняли совместный демарш против Кириченко, который был обвинен также в плохом руководстве народным хозяйством в 1959 году. Он лишился всех ответственных постов и был назначен директором небольшого предприятия в Пензенской, а потом Ростовской областях.
Новым секретарем ЦК КПСС был избран Ф. Р. Козлов, сохранивший и свой пост первого заместителя Председателя Совета министров СССР. Отныне он стал вторым человеком и в Секретариате ЦК, и в Совете министров СССР. По своим моральным качествам Козлов мало отличался от Кириченко, и усиление его власти и влияния вызвало явное беспокойство в Ленинграде, где его знали лучше, чем в Москве. Еще когда Козлов возглавлял ленинградскую партийную организацию, к Хрущеву приезжала специальная делегация ленинградских коммунистов, которая просила не рекомендовать Козлова на областной партийной конференции в качестве секретаря обкома. Однако Хрущев взял его под защиту и не стал проверять выдвинутые против него серьезные обвинения. «Мы только рекомендуем, – заявил Хрущев ленинградцам, – а вы можете и не выбирать Козлова своим руководителем. У вас же тайное голосование».
Из Президиума ЦК КПСС был выведен и Н. Н. Беляев, возглавлявший в 1957–1960 годах партийную организацию Казахстана. Хрущев возложил на него ответственность за плохое положение дел на целине. Урожаи и сборы зерна здесь уменьшились, несмотря на распашку все новых и новых земель. Первым секретарем ЦК КП Казахстана был вскоре избран Д. Кунаев.
На состоявшейся вскоре сессии Верховного Совета СССР депутаты проводили с почетом на пенсию К. Е. Ворошилова. Председателем Президиума Верховного Совета СССР стал теперь Л. И. Брежнев. Тогда же депутаты приняли закон «Об отмене налогов с рабочих и служащих». Отменялся подоходный налог и налог с «холостяков» для всех граждан с зарплатой до 500 (50) рублей в месяц. Окончательная отмена налогов по всем зарплатам и ставкам до 2000 (200) рублей в месяц предусматривалась к 1965 году. Депутаты одобрили закон о завершении в 1960 году перехода на 7-часовой рабочий день (а на подземных работах – на 6-часовой). Верховный Совет принял еще один закон, оказавшийся непопулярным. Речь шла об изменении масштаба цен и всех выплат и зарплат в соотношении 10:1. Формально от изменения масштаба цен и зарплат не страдал никто. При этом втрое сокращались расходы на изготовление денежных знаков, облегчалось применение торговых и иных автоматов, упрощались расчеты. Но население не любит денежных реформ и обмена привычных денежных знаков. К тому же автоматическое снижение цен в 10 раз в государственных магазинах не сопровождалось таким же автоматическим снижением цен на колхозных рынках и в сфере частных услуг. Денег всегда не хватает, а теперь их, казалось, стало еще меньше. В своем стремлении к экономии Хрущев неожиданно предложил отменить многие надбавки к зарплате, которые получали жители Сибири и Дальнего Востока. Это было ошибочное решение, которое увеличило миграцию населения из Сибири в европейскую часть СССР.
Летом 1960 года Хрущев побывал на строительстве экспериментальных домов в Усове, а затем и на строительстве Московской кольцевой автомобильной дороги. Было решено считать Кольцевую автодорогу границей Москвы и передать в распоряжение Московского горисполкома такие подмосковные города и поселки, как Тушино, Перово, Бабушкино, Ховрино и др.