Наряду с нижним этажом для хранения товаров использовалось и непосредственно церковное помещение, где товары размещались у стен в ящиках и бочках и обязательно помечались специальными знаками. Возле алтаря как наиболее охраняемого места находились бочки с вином, но к самому алтарю следовало проявлять уважение и не ставить туда кружки и другие предметы.
Кроме товаров в церкви св. Петра хранились большие (безмен) и малые весы для взвешивания серебра. Запрещалось оставлять без присмотра весы и гири вне стен церкви. Там же хранился опечатанный подлинник скры, которую необходимо было переписать для немцев и для русских, как было указано в специальном постановлении начала XIV в.
Сама церковь не раз служила надежным убежищем для немецких купцов во время конфликтов с новгородцами, о чем свидетельствуют разнообразные документы.
Кроме церквей во дворах находились и другие постройки, о числе и назначении которых трудно судить, особенно в первые периоды существования дворов (в XII—XIII вв.). Относительно XIV—XV вв. сведения о дворовых зданиях содержатся в разных редакциях скры, по которым можно составить хотя бы общее представление.
Установлено, что на Готском дворе располагались соляные амбары, в которых хранилась не только соль, но и другие товары. Здесь же располагалась Морнвегова комната, очевидно, жилое помещение. Морнвег — представитель известной купеческой семьи из Любека, ведущий в конце XIII в. активную торговлю серебром в Новгороде. Возможно, он был в свое время старостой двора, и поэтому в память о нем было названо одно из помещений Готского двора.
Несомненно, что на Готском дворе имелись и другие жилые постройки и амбары. Некоторое представление о них дают материалы раскопок Готского двора, проведенные в 1968–1970 гг. Здесь были обнаружены остатки двух больших срубов, площадь которых равнялась 72,25 кв. м и 110,25 кв. м (рис. 18). Оба сруба были сложены из мощных бревен диаметром 50–60 см, в то время как любые новгородские постройки (жилые, хозяйственные, производственные) построены из бревен, диаметр которых не превышает 16–30 см. Внутри срубов сохранились настилы пола из горбылей диаметром 20–25 см, уложенных на бревнах-переводинах диаметром 20–30 см, что также превышает размеры бревен, используемых для настилов в новгородских постройках.
Открытые в ходе раскопок срубы, несомненно, были остатками амбаров для хранения товаров, чем вызваны значительные размеры строений, мощность бревен, из которых они сложены, отсутствие печей, непременных для жилых помещений. При раскопках не обнаружено каких-либо следов товаров, некогда хранившихся в этих амбарах. Это может быть объяснено тем, что на участке встречены следы сильнейшего пожара, в результате которого погибли не только все товары, но и практически сами сооружения.
Большой интерес для реконструкции Готского двора представляют обнаруженные при раскопках остатки каменного фундамента какой-то постройки. Несмотря на значительные утраты при строительстве позднейших сооружений (срезана до основания вся западная часть каменной постройки), удалось восстановить ее конструктивные особенности и определить назначение. Эта постройка непосредственно примыкала к одному из деревянных срубов. Сохранившаяся часть каменной постройки представляет собой фундамент, сложенный из валунов, скрепленных известковым раствором. Снаружи стены облицованы розовым ракушечником, а внутри заполнены бутовым камнем с известью; кладка сохранилась в высоту на 110 см. Конструктивные особенности соединения амбара и каменной постройки хорошо прослеживаются на стыке южной стены амбара и восточной стены постройки. В стене сруба был сделан паз шириной 60 см и глубиной 25–30 см специально для соединения каменного здания со срубом. Судя по всему, каменная постройка представляла собой башню, о высоте которой судить трудно, но, несомненно, она возвышалась над деревянными постройками двора и исполняла роль сторожевой. Выдвинутая за пределы сруба башня давала возможность просматривать все пространство, примыкавшее к деревянным амбарам. Особенно важно было наблюдение за западной стеной амбаров, со стороны Волхова, где располагались пристани. Следовательно, вход в амбары, а, вероятно, и во двор находился под защитой башни. Обращаю внимание на деревянный фриз из церкви св. Николая в Штральзунде где изображены новгородские купцы, несущие товары в Немецкий двор, вход в который обозначен башней (ил. 8).
Кроме того, башня сама могла служить надежным хранилищем товаров и местом заключения провинившихся купцов. Во второй редакции скры (конец XIII в.) имеется статья о том, что человека, виновного в нанесении увечий другому лицу, обязывали заплатить пострадавшему 10 марок серебра. В противном случае виновный должен был содержаться 10 недель в башне, получая только хлеб и воду.
