Учреждена Указом Президента РФ в 1992 году. Должность председателя Комиссии по Государственным премиям при Президенте РФ традиционно занимали руководители администрации Президента — Сергей Филатов (до 1995), Николай Егоров (1995–1996), Анатолий Чубайс (1996), Валентин Юмашев (1997), Николай Бордюжа (1998), Александр Волошин (с 1999). Секцию Комиссии по литературе возглавлял Сергей Михалков (1992–1998), затем Даниил Гранин (с 1998). Кандидатуры на соискание премий выдвигались издательствами, редакциями газет и журналов, общественными организациями, трудовыми коллективами. Произведения, допущенные к участию в конкурсе, рассматривались секцией Комиссии по литературе, имена лауреатов утверждались Президиумом Комиссии и оглашались Указом Президента РФ к 12 июня — Дню независимости РФ. Денежное обеспечение премии первоначально установлено в 1 500 минимальных размеров оплаты труда, с 1999 повышено до 3 000 минимальных размеров. С 1999 года введена также Государственная премия РФ за произведения для детей и юношества.
Указом Президента РФ от 21.06.2004 года система государственного премирования в стране была изменена. Согласно этому указу, с 2005 года присуждается 6 премий, в том числе 3 — за достижения в области литературы и искусства. Денежное обеспечение каждой из премий установлено в 5 миллионов рублей. Лауреатов определяет совет по культуре и искусству при Президенте РФ, опирающийся на специально создаваемые экспертные комиссии.
1992 — Андрей Битов с романом «Пушкинский дом», Николай Тряпкин;
1993 — Рустам Ибрагимбеков, Фазиль Искандер с книгами «Праздник ожидания праздника», «Стоянка человека», Дмитрий Лихачев, Лев Дмитриев (посмертно), Олег Чухонцев;
1994 — Михаил Гаспаров с книгами «Авсоний. Стихотворения», «Русские стихи 1890–1925 годов с комментариями», Юрий Левитанский с книгой «Белые стихи», Лидия Чуковская с книгой «Записки об Анне Ахматовой»;
1995 — Виктор Астафьев с книгой «Прокляты и убиты», Дмитрий Волкогонов (посмертно), Александр Кушнер с книгой «На сумрачной звезде», Александр Панченко, Григорий Поженян с книгой «Защищая свою крутизну», Леонид Филатов (за телевизионные работы);
1996 — Андрей Битов с романом «Оглашенные», Евгений Рейн со сборником поэм «Предсказание»;
1997 — Григорий Бакланов с романом «И тогда приходят мародеры», Борис Екимов с книгой «Высшая мера», Михаил Кураев с трилогией «Семейная хроника», Рустам Ибрагимбеков (за сценарий кинофильма «Белое солнце пустыни»);
1998 — Инна Лиснянская с книгой стихов «Из первых уст», Александр Ревич с переводом «Трагических поэм» А. д'Обинье, Майлен Константиновский (за произведения для детей и юношества), Никита Струве (за культурно-просветительную деятельность);
1999 — Владимир Маканин с романом «Андеграунд, или Герой нашего времени», Борис Заходер с книгой «Избранное» (за произведения для детей и юношества);
2000 — Андрей Волос с романом «Хуррамабад», Владимир Войнович с романом «Монументальная пропаганда», Валентин Непомнящий с книгой «Пушкин. Русская картина мира» (за культурно-просветительную деятельность);
2001 — Константин Ваншенкин с книгой стихов «Волнистое стекло», Даниил Гранин с романом «Вечера с Петром Великим», руководители издательства «Вагриус» (Олег Васильев — посмертно, Владимир Григорьев, Алексей Костанян, Татьяна Макарова, Глеб Успенский) (за культурно-просветительную деятельность);
2002 — Вацлав Михальский с первой книгой романа «Весна в Карфагене», Новелла Матвеева, Ирина Токмакова с книгой для детей «Счастливого пути», Григорий Горин (посмертно) с пьесой «Шут Балакирев», Людмила Петрушевская с пьесой «Московский хор», Ирина Прохорова (за культурно-просветительскую деятельность);
2003 — Василий Белов с романом «Час шестый», Канта Ибрагимов с романом «Прошедшие войны», Григорий Кружков с переводами из английской и американской поэзии, Инна Соловьева с трудами по истории МХАТа, Виктор Астафьев (посмертно) с рассказами, легшими в основу спектакля «Пролетный гусь», поставленного на сцене МХАТа;
2005 — Белла Ахмадулина;
2006 — премия по литературе не была присуждена;
2007 — премия по литературе не была присуждена; Александр Солженицын награжден премией за заслуги в гуманитарной деятельности;
2008 — премия по литературе не была присуждена.
Учреждена в 1998 году Комиссией при Президенте РФ по Государственным премиям РФ. На соискание премии «может быть выдвинут поэт за создание выдающихся поэтических произведений, вносящих вклад в современную российскую литературу и приумножающих нравственное богатство российской культуры, а также создатель и исполнитель песен собственного сочинения за наивысшие достижения в жанре авторской песни, сопоставимые по своим художественным достоинствам со значением в российской культуре творческого наследия Б. Окуджавы». В соответствии с указом Президента РФ от 21.06.2004 года эта премия более не присуждается.
1998 — Александр Городницкий;
1999 — Юлий Ким;
2000 — Дмитрий Сухарев;
2001 — Александр Дольский;
