Исследования женского некрополя пролили свет и на многие тайны русского двора, установив истинные причины странных смертей кремлевских красавиц. Загадочная и темная история связана и со смертью великой княгини Елены Глинской, матери Ивана Грозного. Ивану было всего 3 года, когда умер его отец Василий III. Во главе Руси встала его мать, властная, умная и решительная, которая пять лет правила при малолетнем сыне вместе со своим любовником Иваном Телепневым-Оболенским, по прозвищу Овчина. В результате ее правления завертелось колесо интриг и доносов, начались боярские заговоры. Вдовствующая княгиня бросила в застенок всех претендентов на престол: Андрея Шуйского, Андрея Старицкого, собственного дядю, князей Бельских и др. Однако вскоре и сама Елена пала жертвой интриг. Она внезапно скончалась 27 лет от роду, что породило множество самых противоречивых слухов, в том числе и об отравлении.
Версия об отравлении Елены Глинской подтвердилась в конце XX века, когда историки и криминалисты изучили ее останки. Проведенный спустя века спектральный анализ медно-рыжих волос Елены Глинской показал, что молодую княгиню «извели» с помощью солей ртути, концентрация которой в тысячу раз превышала норму. Так 400 с лишним лет спустя удалось узнать причину гибели великой княгини и реконструировать ее внешность. По словам ученых, она была довольно высокого для женщин того времени роста – около 165 см и очень хорошо сложена.
В исторической литературе не раз тиражировалась версия, что своих сыновей, Ивана и Юрия, Елена Глинская родила не от стареющего мужа, великого князя Василия III, а от своего молодого любовника Ивана Овчины. И только сегодня наконец доказано, что Иван – сын Василия и Глинская чиста перед мужем. Великую княгиню «реабилитировал» эксперт-криминалист Сергей Никитин. Реконструированный им портрет Софьи (Зои) Палеолог, матери великого князя Василия III, не оставляет сомнений, что царь Иван IV Грозный – ее кровный внук.
12 ноября 1472 года племянница последнего византийского императора Зоя Палеолог, сосватанная за великого князя Ивана III, торжественно въехала в Москву. Ее привезли в церковь под благословение митрополита, потом в хоромы матери великого князя, где жених и невеста впервые увидели друг друга. Свадьба состоялась в тот же день, так византийская принцесса Зоя Палеолог стала московской великой княгиней Софьей Фоминичной.
Великая княгиня Елена Глинская.
По представлениям того времени, Софья (Зоя) Палеолог была очень привлекательна, с удивительно красивыми глазами, а главное, она отличалась острым умом и статью, достойной византийской принцессы. Супруга Лоренцо Медичи Клариче Орсини находила юную Палеолог очень приятной: «Невысокого роста, восточное пламя сверкало в глазах, белизна кожи говорила о знатности ее рода».
