В 1952 г. командир литовских партизан А.Раманаускас издал приказ о прекращении партизанской войны. Но очаги сопротивления в отдельных местах оставались до середины 60-х годов. Это были уже не партизаны, а люди, скрывавшиеся от арестов.
Трагедия партизанского движения, как и всей Литвы, в том, что победить в этой борьбе не было никакой возможности: слишком неравными были силы.
Нельзя не отметить, что в годы войны при содействии националистов десятки тысяч призывников Латвии и Эстонии были мобилизованы в латышский добровольческий легион и эстонскую гренадерскую дивизию СС немецкой армии. В 1944 г. генерал С.Раштикис предложил план мобилизации литовцев – до 150 тысяч человек. Командные кадры этих соединений составили бывшие офицеры Литовской армии и военизированных организаций.
При активном участии добровольческих полицейских батальонов за годы оккупации в Литве было уничтожено до 700 тысяч гражданских лиц и военнопленных, вывезено в Германию до 36 тысяч человек. На территории Латвии уничтожено более 600 тысяч гражданских лиц и военнопленных, увезено в Германию более 280 тысяч человек. Жертвами нацистского террора в Эстонии стали 125 тысяч мирных жителей и военнопленных. Предчувствуя скорый конец войны, пособники гитлеровцев предпринимали попытки попасть в западные земли Германии, занятые американскими, английскими, французскими войсками, или бежать в Швецию. Так, генеральный инспектор латышского легиона СС Р.Бангерский приказал латышским частям гитлеровской армии «...интернироваться в зонах, занятых англичанами, американцами или французами». Во исполнение этого приказа в плен английским и американским войскам сдались остатки 15-й латышской дивизии и 20-й дивизии СС немецкой армии. В конце войны на Запад бежали высшие чины окруженной в Курляндском котле 19-й латышской дивизии СС.
При активной поддержке общественных деятелей Швеции, посольств США и Великобритании в конце войны начали формироваться центры националистической эмиграции: «Прибалтийское гуманистическое общество», «Организация эстонской помощи», «Эстонский комитет» и др. При их содействии по соглашению между Швецией и фашистской Германией под видом «транспортов раненых» в Швецию было вывезено 7 тысяч лиц шведской национальности, проживавших на островах и западном побережье ЭССР. В их числе было немало эстонцев – порядка 3000-3500 человек.
После окончания войны на территории таких стран, как ФРГ, Австрия, Дания, Бельгия и Швеция, оказалось около 260 тысяч так называемых перемещенных лиц из Советской Прибалтики, которые в дальнейшем явились важнейшим источником пополнения кадров для подрывной деятельности против СССР.
Период с 1946 по 1951 г. для прибалтийской эмиграции стал временем больших надежд и активной деятельности. При этом западные оккупационные власти делали все возможное, чтобы латыши и эстонцы из соединений СС, которые лично руководили расправами над мирными жителями Прибалтики и Белоруссии, смогли избежать заслуженного наказания, как того требовал приговор Нюрнбергского военного трибунала.
Во время оккупации западных районов Белорусской ССР здесь были созданы польские формирования, которые под флагом борьбы за «независимость великой Польши» участвовали в подавлении партизанского движения, расправлялись над белорусским населением.
Подобные же действия против Советской власти осуществляли отряды айзсаргов в Латвии, националистические элементы в Эстонии. Организации националистов часто изображали оппозиционность и независимость по отношению к германскому фашизму, а на деле были тесно связаны с ним.
Одним из основных принципов действий боевых формирований националистов была изуверская жестокость, направленная на устрашение населения. В одной из своих инструкций националистическому подполью С.Бандера заявлял: «Наша власть должна быть страшной». А в другой инструкции лиц, поддерживающих Советскую власть, предлагалось ликвидировать всеми доступными методами (расстрел, повешение и даже четвертование) с запиской на груди: «За соучастную работу с НКВД». На практике так действовали не только оуновцы, но и представители других незаконных вооруженных формирований. Например, в ночь на 30 ноября 1944 г. в селе Сцянка Львовской области они сожгли 30 строений и убили 15 жителей. Нападение сопровождалось дикими зверствами – в горящие дома бандиты бросали раненых, взрослых и детей. В ноябре этого же года в деревне Леваны Литовской ССР многие ее жители были убиты за то, что взяли помещичью землю.
Не получая поддержки от широких слоев населения, националисты и их вооруженные отряды становились на путь террора и диверсий. От рук боевиков в 1944 – 1951 гг. погибли тысячи советских людей, прежде всего из числа партийного и советского актива, личного состава армии, пограничных и внутренних войск, органов МВД и МГБ.