Орочимару отметил, что Кидомару был умнейшим из Четвёрки Звука, на что указывает его ожесточенный стиль боя и стремительные боевые стратегии. Кидомару всегда бы превосходным тактическим аналитиком, способным быстро и продуктивно определить слабое место противника. Он не упускал ни малейшего противоречия и не совершал ни одного лишнего движения, совершенствуя следующую волну исходя из того, что он узнал ранее. Во время сражения с Неджи Хьюгой, Кидомару смог использовать всё, что он узнал своими атаками, чтобы раскрыть способности Бьякугана и обнаружить его скрытое слепое пятно, а затем соответствующим образом перестроить свою стратегию, намереваясь извлечь наибольшую выгоду из добытой информацию.
Под крылом Орочимару, Кидомару получил знания о многих техниках и ниндзя Конохи, поскольку смог узнать Какаши Хатаке и слышал о Мягком Кулакеклана Хьюга от своего господина.
Несмотря на свое предпочтение сражаться на расстоянии, Кидомару был компетентен в области тайдзюцу, что видно во время столкновения с Саске. В аниме, он показал хорошие навыки тайдзюцу против Неджи, мастера в стиле Мягкого Кулака. Шикамару утверждал, что его уровень соответствует как минимум джоунину. Более того, способности Кидомару были достаточно хороши, раз уж Кабуто посчитал нужным воскресить его.
У Кидомару уникальное строение тела: он обладает двумя дополнительными парами рук, поэтому в сумме у него восемь конечностей, что сближает его с образом паука еще больше. Они позволяют ему добавлять дополнительную силу и разнообразие в его атаки, держать множество орудий одновременно, одновременно заниматься несколькими задачами и формировать различные ручные печати сразу. Он также мог использовать множество рук для натяжения тетивы своего лука до невероятного напряжения, резко увеличивая пробивную мощь стрелы.
Ко всему прочему Кидомару обладал третьим глазом на лбу, который обычно скрывает его протектор. Во время серьезных боёв он раскрывал этот глаз. Благодаря третьему глазу в разы возрастает его восприятие и точность, поэтому он может поражать жизненно важные точки противника своими стрелами на большом расстоянии. Зрение третьего глаза было достаточно острым, чтобы определить, что стрела отклонилась от намеченной цели на 15 см, даже если между ней и Кидомару расстояние составляло не менее 50 метров.
Как и остальные члены Четверки Звука, Кидомару носил Проклятую Печать, которая увеличивает его физические возможности и способности в области ниндзюцу. При активации 1 Уровня, по его телу распространяются витые, сплетённые узоры. На 2 Уровне Джуина его кожа становится тёмно-красной, его зрачки окрашиваются в жёлтый, а склера темнеет, заостряются зубы, удлиняются ногти на руках и отрастают длинные седые волосы. Кроме этого, у Кидомару вырастают рога на лбу, плечах и локтях и расширяется рот, позволяя ему создавать более утончённое оружие. Наконец, глаз на лбу, закрытый и спрятанный под протектором, раскрывается и, по-видимому, одаряет его большей точностью в его атаках и, возможно, способностью видеть чакру.
Кидомару обладал способностью создавать сети из паутины, оснащая свою слюну или пот чакрой. Он может использовать сети, дабы связать, захватить или обнаруживать врагов. Эти нити были чрезвычайно липкими, но в то же время прочными и эластичными, поскольку его чакра постоянно протекала сквозь паутину, нити из неё было невозможно разрезать обычным оружием, таким как кунай. Тем не менее, Мягкий Кулак может разорвать их, ведь этот боевой стиль основан на использовании чакры пользователя для того, чтобы бить по определенным точкам.
Также он мог создавать золотую жидкость, которая превращается в блокирующий чакру металл при контакте с воздухом. Прожевывая жидкость из паутины внутри своего рта, он был способен сделать её более твердой и подобной резине, позволяя ему создавать различные виды оружия. Этот прочный материал мог также выделяться и через потовые железы и обращаться в доспехи, покрывающие тело, которые были способны защитить Кидомару от физических атак, металлического оружия и даже от основанных на чакре атак, таких как Мягкий Кулак. Наконец, он мг формировать из нее смертельно опасные лук и стрелы, которые могут валить деревья при выстреле.
Снова подтверждая свое родство с пауками, Кидомару был способен призвать Кьёдайгумо, гигантского паука, который мог порождать бесчисленное множество более мелких паучков для использования Паучьего Дождя, создающего паутину такой же прочности, что и сам Кидомару. Он также мог заставить Киодайгумо обрушиться на врага сверху для помощи в битве.