Широкую деятельность развернула партийная организация Вильнюса, руководимая Юозасом Витасом-Валунасом, который сплотил патриотов города и с ними включился в борьбу против оккупантов. Среди этих борцов были старые коммунисты подпольщики Я. Пшевальский, И. Витенберг, С. Мадейскер и другие. От имени антифашистской организации они выпускали в Вильнюсе подпольные газеты «Тевинес фронтас» («Отечественный фронт»), «Штандар вольносци», («Знамя свободы») и воззвания на литовском и польском языках. Весной 1943 года был арестован член организации Вацис Казлаускас. В июне 1943 года в Вильнюсе гитлеровцы арестовали Юозаса Витаса. После жестоких пыток он был убит. Однако тяжелые удары не подорвали всей вильнюсской организации. Восстановив связь с подпольным Южным обкомом КП Литвы и организованным М. Мицейкой Вильнюсским комитетом, она продолжала борьбу с оккупантами, выпускала газеты «Звензковец» («Профсоюзник») и «За вольносць» («За свободу»).
Большую работу проделала подпольная организация Шяуляй и Шяуляйского уезда, которая насчитывала 15 партийных групп, объединявших 75 членов, партийная организация Паневежиса, которая охватывала Шедувскую, Науместскую, Крекенавскую, Трошкунскую, Шимонскую, Купишкскую и Вешинтскую волости.
Многочисленная партийная организация имелась в Тракайском уезде (секретарь М. Афонин). В 1943 году она насчитывала 27 первичных партийных организаций, в рядах которых имелось 117 коммунистов. В Тракай, Аукштадварисе, Онушкисе, Семелишкесе, Лентварисе, Виевисе, Эйшишкесе, Жасляй, Ваилькининкай были созданы волостные комитеты партии. Боевая партийная организация имелась в Каунасе, она насчитывала 80 членов партии. Подпольный комитет Каунаса и Каунасского уезда поддерживал связь с подпольщиками и партизанскими отрядами Кедайнского, Тракайского, Мариямпольского и Укмергского районов.
В Каунасе действовала антифашистская организация «Ковос преш фашизма саюнга» («Союз борьбы с фашизмом»). Здесь в подпольную работу включились врачи Элена Куторгене, Масайтис, народный художник — резчик по дереву Юозас Лауринкус, работница комбината «Дайле» Ольга Вайвадене, рабочий Владас Чибилис и многие другие. Подпольный Каунасский горком партии обязал членов комитета Антанаса Керснаускаса и Пятраса Трофимова поддерживать через Владаса Чибилиса связь с этой организацией.
Под руководством партийных организаций антифашистские организации были созданы и активно работали в Паневежисе, Утене, Кедайняй, Мариямполе и других уездах. Они оказывали помощь бежавшим военнопленным, обеспечивали их продуктами, одеждой и даже оружием.
Усилению действий партизанских отрядов и подпольных организаций в значительной мере способствовало расшатывание оккупационного режима, вызванное наступательными операциями Советской Армии. Многие наиболее боеспособные части фашистских войск, несшие «тыловую» службу в Литве, были направлены на Восточный фронт для пополнения перемолотых в ожесточенных боях частей. Дело дошло даже до того, что оккупанты, несмотря на явное, все растущее сопротивление народа, стали вербовать в свою армию молодежь Прибалтики. А когда фашистская Германия получила смертельный удар под Сталинградом, на Прибалтику была распространена «тотальная мобилизация».
Гитлеровцы не скупились на посулы и как об особой «чести» для прибалтов объявили о вербовке молодежи Прибалтики в эсэсовские «легионы» для борьбы с Советской Армией и партизанами, обещая «легионерам» различные привилегии и блага.
В ответ на этот кощунственный призыв гитлеровцев прибалтийская молодежь усилила борьбу с оккупантами. На митинге молодежи прибалтийских республик, состоявшемся 15 апреля 1943 года в Москве под председательством поэтессы Саломеи Нерис, была разоблачена вероломная политика фашистских захватчиков и принята развернутая программа антифашистской борьбы молодежи Прибалтики. Выступления на митинге транслировались по радио, а его решения, размноженные в десятках тысяч экземпляров, дошли до молодых литовцев, латышей и эстонцев, находившихся под ярмом гитлеровской оккупации.
О том, за кем пошла литовская молодежь, убедительно говорят факты. Желающих служить в «легионах» фашистов, принимать участие в истреблении своего народа, в борьбе против Советской Армии почти не оказалось. Например, в Швенченисе в «легион» записались только три кулацких сынка. Повсеместно вербовочные пункты в «легион» пустовали. Затея гитлеровцев лопнула, как мыльный пузырь.
Пытаясь как-то наскрести людей и создать хотя бы подобие «легиона», гитлеровские власти и их прислужники — буржуазные националисты созвали в Каунасе так называемую «конференцию литовцев». Но и это не помогло: только незначительное число населения — сынки кулаков и их собратьев в городах согласились служить в эсэсовских бандах. Фашисты были вынуждены открыто признать в печати, что
