Бомбардировка Токио повлияла и на позицию морского генерального штаба. Даже самым ярым противникам плана нападения на о. Мидуэй было теперь трудно отрицать, что угроза с востока если и не больше, чем потенциальная угроза со стороны Австралии, но, во всяком случае, требует более срочных и решительных контрмер. Провал попытки защитить столицу от нападения затрагивал морской генеральный штаб в такой же мере, как и штаб Объединенного флота. В результате противоречия, возникшие в связи с планом операции против о. Мидуэй, сразу же исчезли, и Объединенный флот получил возможность спокойно заняться разработкой окончательного варианта плана операции.
К концу апреля план был составлен и утвержден адмиралом Ямамото. Затем согласно установленному порядку он был передан начальнику морского генерального штаба, адмиралу Нагано, который тоже очень быстро утвердил его. 5 мая адмирал Нагано от имени императора издал приказ № 18, в котором в немногих словах главнокомандующему Объединенным флотом приказывалось «во взаимодействии с сухопутными силами осуществить оккупацию о. Мидуэй и ключевых пунктов в западной части Алеутских островов».
В это же время армейское и военно-морское управления императорской ставки договорились о порядке взаимодействия между силами армии и флота в операции по захвату о. Мидуэй. По этому соглашению армия обязывалась выделить усиленный пехотный полк для высадки десанта. Предполагалось, что после оккупации острова полк будет отозван. Удержание острова возлагалось на военно-морские силы. Местом сосредоточения десанта был предварительно избран о. Сайпан. Войска десанта намечалось перебросить сюда к 25 мая. В соглашении не был намечен день высадки на о. Мидуэй, но указывалось, что она должна начаться до 20 июня, одновременно с действиями против западной части Алеутских островов.
Вопрос о проведении операции по захвату о. Мидуэй теперь был окончательно решен. Объединенному флоту удалось настоять на своем благодаря той поддержке, которую невольно оказали ему Дулиттл и его летчики. На повестку дня встала трудная задача за несколько недель организовать и подготовить флот для проведения самой большой по своим масштабам операции за всю 70-летнюю историю современного японского флота.
Окончательный план операции по захвату о. Мидуэй, разработанный штабом Объединенного флота и официально названный императорской ставкой «операцией О. М.», явился результатом длительной и напряженной работы многих людей. В общих чертах эта операция была разработана старшим офицером оперативного отдела капитаном 1 ранга Куросима. Он был автором руководства, в котором излагались основы тактики Объединенного флота при ведении нм решающего сражения с флотом противника. Главная роль в боевых действиях отводилась линейным кораблям. Разработкой конкретных разделов плана занимались другие офицеры штаба, каждый в сфере своей компетенции. Общее наблюдение осуществлялось инициативным и изобретательным начальником штаба контр-адмиралом Угаки, сторонником наступательных действий флота против Гавайских островов.
Но в плане операции по захвату о. Мидуэй сильнее всего нашли свое выражение идеи и личные качества выдающейся фигуры японского флота, главнокомандующего Объединенным флотом адмирала Исороку Ямамото. Оценку этому выдающемуся руководителю следует давать более сведущим лицам, чем я. Здесь мне хочется рассказать лишь о некоторых впечатлениях и мыслях, которые возникали у меня — одного из многих сотен офицеров, служивших под его командованием, — при встречах с ним.
Если бы в начале войны на Тихом океане офицеров японского военно-морского флота спросили, кого бы они хотели видеть главнокомандующим Объединенным флотом, то подавляющее большинство, без всякого сомнения, высказалось бы за адмирала Ямамото. Я убежден, что в число его сторонников вошли бы и все офицеры-летчики японского флота. И действительно, когда по окончании войны американские историки задали этот щекотливый вопрос ряду бывших офицеров японской морской авиации (в их числе был и я), наш единодушный ответ был — «адмирала Ямамото».
Огромная популярность Ямамото среди летчиков морской авиации объясняется тем, что он был одним из самых ярых ее сторонников. Не являясь летчиком по профессии, Ямамото еще в звании капитана 1 ранга был назначен заместителем командира касумигаурского учебного корпуса морской авиации. С этого времени он занимал в авиации ряд важных постов. Морская авиация находилась тогда в самой ранней стадии своего развития и нуждалась в сильном руководителе и защитнике. Ямамото с энтузиазмом выполнял свои многочисленные обязанности, во всем проявляя присущие ему дальновидность и чуткое отношение к людям.