Похоронен на Ваганьковском кладбище.
Ещё только готовясь к поприщу художника, Иван Шишкин сформулировал основные качества живописца, каковыми они тогда ему представлялись, – «трезвость, умеренность во всём, любовь к искусству, скромность характера, добросовестность и честность». А будучи уже выдающимся мастером, признанным «царём леса», Иван Иванович счёл нужным прокомментировать однажды им сказанное: «Все эти правила вошли тогда в плоть и кровь – с годами жизнь, конечно, сгладила многое, но общий взгляд на искусство и природу остался тот же, и впоследствии, когда началась художественная деятельность, – взгляды оказались настолько сформированными, что могли противостоять тогдашнему направлению школы и Академии». Бытует мнение, что на протяжении всей своей творческой жизни Иван Иванович Шишкин разрабатывал одну тему. И если эта тема – беспредельная любовь к родной природе – от неприметной былинки до необъятных, подёрнутых дымкой лесных далей, – оспорить сие утверждение не представляется возможным.
Когда в январе 1832 года в елабужской купеческой семье Шишкиных родился сын Иван, все члены уважаемого в городе клана пребывали в уверенности, что на свет появился будущий верный и сноровистый продолжатель семейного дела. Но человек предполагает, а Бог, как известно, располагает, и, создав новоявленного Ивана сына Ивана любознательным и очень чутким к красоте, Всевышний явно не рассчитывал увидеть его в будущем за подсчётами растущих купеческих барышей. Отец мальчика, Иван Васильевич Шишкин, купец 2-й гильдии, был человеком неординарным. Интересы его простирались далеко за пределами коммерческого дела. Женой Ивана Васильевича стала Дарья Романовна Каргина (или Киркина), из казанских мещан. С хозяйством и домом супруга Шишкина управлялась отменно. К тому же она оказалась прекрасной матерью – «строгой и справедливой».
Женитьба и рождение детей не помешали Ивану Шишкину успешно сочетать общественную и торговую деятельность. Став к тому времени городским головой, Иван Васильевич, «…пленённый красотой и мудростью мира», успевал интересоваться многим – историей, археологией, техническими изобретениями, – и всё это не поверхностно, а подробно, обстоятельно. Его даже называли «елабужским Кулибиным». На собственные средства Иван Васильевич построил для горожан водопровод. Серьёзно увлекшись краеведением, списался с московским профессором-земляком, изучавшим елабужские древности. В письмах купец и учёный обсуждали судьбу так называемого Чёртова городища. Иван Шишкин для начала детально исследовал древний памятник, а позднее, практически полностью на свои деньги, отреставрировал башню городища. Иван Васильевич – автор «Практического руководства к построению разных мельниц», член-корреспондент Московского археологического общества, издавший «Историю города Елабуги» – первую серьёзную работу о скромном уездном центре.
