«Крепости» стелились над самой водой, чтобы бомбы после сброса отрекошетили от водной поверхности в борт крейсера — топмачтовое бомбометание. Одна 225-кг попала в район авиационной катапульты, вызвав взрыв двух находившихся в торпедных аппаратах торпед тип 93. Сильные повреждения получил корпус и машинное отделение. Хирага был прав в отношении излишества торпед на тяжелых крейсерах. Легкий крейсер «Сендай» пытался буксировать крейсер «Аоба» на Трук, но в конечном итоге ввиду опасности затопления корабля вынужден был посадить «Аобу» на мель. Через несколько дней к крейсеру подошло спасательное судно «Ямабико Маару», которое откачало из отсеков корпуса воду, после чего на пробоины завели пластыри и «Сендай» смог возобновить буксировку «Аобы» на Трук. На Труке высокие начальники осмотрели крейсера, приняв решение опять отправить корабль на ремонт в Куре. В сухой док крейсер «Лоба» был поставлен 1 августа 1943 г.
25 февраля 1944 г. крейсер «Аоба» покинул сухой док базы Куре. В Сингапуре крейсер модернизировали под использование в качестве флагмана 16-й дивизии, которой командовал адмирал Саконю Наомаса. «Аоба» выполнил несколько транспортных рейсов между Сингапуром и островами Голландской Индии и южной частью Филиппин — к этому времени Япония лишилась большей части своих транспортов, а тс, которые уцелели, уже не могли прорывать блокаду, учиненную американским флотом. Планировался рейдерский поход в Индийский океан совместно с крейсерами «Тоне» и «Чикума», но его отменили. «Аоба» продолжал доставлять людей и грузы изолированным японским гарнизонам до 4 июля 1944 г., когда его поставили на текущий ремонт в Лингга Роад, Сингапур. После ремонта во время совместного с легким крейсером «Кино» перехода в Манилу, крейсер «Аоба» получил попадание одной из шести выпущенных субмариной «Брим» торпед. Торпеда взорвалась в машинном отделении японского корабля. Крейсер «Кино» отбуксировал «Аобу» в военно-морскую базу Кавите, что недалеко от Манилы. Здесь крейсер неоднократно подвергался налетам американской авиации — бомбы падали рядом, но ни одна в корабль не попала. «Аобу» в который раз отремонтировали, но не до конца. Крейсер ушел в Куре, где его 12 сентября 1944 г. поставили в сухой док. Американцы не оставили «Аобу» и в Курс: волна за волной накатывали палубные самолеты с американских авианосцев на поврежденный японский крейсер, который к тому же стоял в сухом доке. Зенитная артиллерия крейсера была включена в состав ПВО базы Куре, для чего корабль вывели из дока и притопили на мелководье рядом с военно-морской верфью. 28 июля ставший зенитной батареей крейсер подвергся мощному удару самолетов авианосного соединения Тэск Форс 38. «Аоба» получил фатальное попадание 225-кг бомбой, которая взорвалась в межпалубном пространстве. В тот же день в крейсер попало еще не менее трех 225-кг бомб, сброшенных с «Либерейтора». Корпус корабля просто развалило. Из списков императорского японского флота крейсер «Аоба» исключили 20 ноября 1945 г.