Мятежники применяли следующие методы террора: убийство или захват должностных лиц; поджоги и грабежи; минирование автобусов магнитными минами; использование автомобилей, начиненных взрывчаткой (взрыв автомобиля в г. Кабуле у посольства Индии весной 1987 г.); использование детей и подростков для установки мин на легковые автомобили должностных лиц; подрыв опор линий электропередач; использование домашних животных для доставки взрывчатого вещества в районы базаров; применение на базарах и других местах скопления людей различных мин-сюрпризов (детские игрушки, авторучки, зажигалки и т. п.); запрет торговли в городах. Наиболее характерным способом осуществления диверсий являлся подрыв различных взрывных устройств в общественных местах, в зданиях учреждений и ведомств, гостиницах, кинотеатрах, учебных заведениях и т. д. Особенно часто это практиковалось во время проведения различных праздников и других массовых мероприятий (например, на похоронах лидера пакистанских пуштунов Гафар Хана в январе 1988 г. в Джелалабаде).
Применяя в широких масштабах террор и диверсии, оппозиция старалась создавать в стране обстановку страха и неуверенности среди мирных жителей, поднять недоверие к государственной власти, показать неспособность правительства навести порядок и обеспечить безопасность населения. Кроме того, это не давало возможности наладить нормальную экономическую деятельность, вследствие чего ухудшался жизненный уровень населения, что также вызывало его недовольство правящим режимом. Причем масштабы проведения террористических акций постоянно расширялись.
Подготовка террористов и поставки малогабаритного новейшего вооружения создали предпосылки для распространения диверсий на другие страны, в том числе и США. Как сообщалось осенью 1987 г., Иран завладел партией зенитных ракет «Стингер», которые ЦРУ переправило афганским партизанам. Иранцы готовились использовать их против кораблей, курсировавших под защитой ВМС США в Персидском заливе. В замешательстве американские официальные представители утверждали, что смертоносные зенитные ракетные комплексы «Стингер» были «похищены» у невинных афганских моджахедов. Однако в действительности, как это выяснил журналист лондонской газеты «Обсервер» Сайра Шах, американские и пакистанские официальные представители передали ракетные комплексы одному руководителю фундаменталистов, который, как известно, ранее с целью наживы дважды перепродавал партии оружия.
После прихода к власти в Афганистане моджахедов американцы тоже стали проявлять озабоченность активизацией исламистов и выражать заинтересованность в поиске возможности выкупить и уничтожить поставленные ранее афганским мятежникам ПЗРК «Стингер», чтобы предотвратить их использование в террористических целях. В частности, первый секретарь посольства США Роберт Байер в беседе в Душанбе с представителем российских войск в январе 1993 г. просил предоставить информацию о местах купли-продажи «Стингеров» на территории Таджикистана.
6. Некоторыми командирами оппозиционных отрядов использовался и такой прием, как выход на переговоры (в случае угрозы разгрома) с правительственными органами и заключение соглашений о прекращении огня. Цель — выигрыш времени, сохранение сил и средств, получение от государства соответствующей помощи. При этом так называемые «договорные главари» оставались связанными с мятежным движением. Отмечались такие действия и на высоком уровне. Например, при проведении операции по деблокированию дороги на Хост («Магистраль») в декабре 1987 г., когда в результате успешных действий советских войск возникла угроза захвата основного базового района Срана. В это время в Кабуле проходила Лойя Джирга, на которую прибыли посланцы Джелалуддина с предложением о перемирии, и оно по предложению президента РА сразу же было принято. Войскам поступила команда прекратить дальнейшее продвижение и закрепиться на занимаемых позициях. Пауза длилась пятнадцать дней. За это время мятежники срочно вывозили боеприпасы и другие материальные средства со складов, расположенных в Сране, в труднодоступные горные районы. Несмотря на неоднократные доклады Наджибулле об этом, он запрещал возобновлять боевые действия. И только когда база опустела, поступил приказ на продолжение операции, якобы потому что руководство оппозиции отказалось от перемирия. Но даже в «остатке» советские войска захватили и уничтожили только реактивных снарядов более 100 тыс. Мне трудно судить о мотивах, побудивших президента Наджибуллу на такой шаг, но нельзя не учитывать, что его родовые корни из этих мест и ему небезразлично было, как будут развиваться здесь боевые действия. Очевидно, он хотел продемонстрировать… землякам свою лояльность, а может быть… он надеялся установить сотрудничество с моджахедами. Вот в какой обстановке приходилось воевать советским войскам.