Спустя два года Прохор заболел водянкой. Болезнь протекала очень тяжело. Наставник Прохора, отец Иосиф, другие монастырские старцы ухаживали за ним. Опасаясь за жизнь больного, они хотели вызвать к нему врача, однако Прохор просил этого не делать. Он так сказал отцу Пахомию: «Я предал себя, отче святый, Истинному Врачу душ и телес – Господу нашему Иисусу Христу и Пречистой Его Матери»… В эти дни Прохору было видение: в несказанном свете явилась Матерь Божия в сопровождении святых апостолов Иоанна Богослова и Петра. Она коснулась жезлом бока больного, тотчас жидкость, наполнявшая его тело, стала вытекать, и Прохор быстро поправился.
Вскоре на месте явления Божией Матери была построена больничная церковь, один из приделов которой был освящен во имя преподобных Зосимы и Савватия Соловецких. Престол для придела преподобный Серафим соорудил своими руками из кипарисового дерева и всегда приобщался Святых Тайн в этой церкви.
Когда Прохору исполнилось 32 года, его постригли в монашество. При постриге ему дали имя Серафим, что означает «пламенный». С еще большим старанием принялся отец Серафим за монашеские подвиги, и вскоре его посвятили в иеродиаконы. В этом служении он провел шесть лет.
Однажды во время литургии, в Великий Четверг, с ним случилось чудо.
После этого видения преподобный Серафим изменился в лице и не мог вымолвить ни слова; его под руки ввели в алтарь, где он два часа простоял неподвижно. Еще суровее стали его подвиги: теперь все ночи до утра отец Серафим проводил в молитве.
