В целях усиления обороны крепости с моря и защиты внешнего рейда по указанию С.О. Макарова была произведена постановка мин, оборудовано боновое заграждение, усилен корабельный дозор, расширена сеть береговых наблюдательных постов, установлены дополнительные станции для освещения рейда, усилена и реорганизована береговая оборона приморского фронта. Кроме того, было организовано взаимодействие эскадры с береговыми батареями при совместном отражении атак противника с моря, приняты срочные меры к быстрейшему вводу в строй поврежденных кораблей и осуществлен ряд других мероприятий, которые во многом повысили обороноспособность Порт-Артура с моря. Одновременно с этим была начата планомерная боевая подготовка эскадры, целеустремленная на решение поставленных перед ней задач.
Особое внимание было обращено на повышение боевой готовности эскадры. С этой точки зрения первостепенное значение имел быстрый выход кораблей на внешний рейд в случае внезапного появления японского флота у Порт-Артура. Раньше для этого требовалось две полных воды, что не позволяло в короткий срок сосредотачивать на внешнем рейде всю эскадру. Благодаря хорошо продуманной последовательности выхода кораблей с внутреннего рейда на внешний, с учетом осадки их и постепенности повышения уровня воды с приливом, Макарову удалось добиться осуществления этого маневра за одну полную воду, что значительно повысило готовность эскадры к выходу в море.
Все мероприятия, производившиеся по указанию Макарова в целях усиления обороны Порт-Артура с моря, повышения готовности эскадры и улучшения организации боевой подготовки кораблей, отличались глубокой продуманностью, целеустремленностью и последовательностью и, несомненно, должны были дать положительные результаты. И надо сказать, что личный состав кораблей верил в это и надеялся, что вице-адмирал Макаров выправит положение дел на Тихоокеанской эскадре.
Принимая меры по подготовке эскадры к активным действиям, Макаров вместе с тем не забывал и об изучении обстановки на театре, и об организации обороны своего побережья на случай высадки неприятельских десантов. С этой целью он организовал систематическую разведку вдоль побережья Ляодунского полуострова эскадренными миноносцами. При выполнении разведки русским миноносцам нередко приходилось вступать в бой с превосходящими силами противника30. Весь март шли усиленные тренировки эскадры. Пользуясь каждым удобным случаем, командующий флотом выводил корабли в море, чтобы выработать и закрепить навыки совместного плавания. Ежедневно на разведку от Порт-Артура высылались миноносцы (парами и даже отрядами). На рейде была организована сторожевая служба. Все это позволило в считанные дни значительно повысить боеготовность эскадры.
Ни Морское министерство, ни император не разделяли взглядов Макарова. Вместо помощи к нему направляли подчиненных, которые только мешали адмиралу. Так, в качестве начальника одного из отделов штаба командующего флотом был назначен двоюродный брат Николая II великий князь Кирилл Владимирович, не обладавший ни необходимыми знаниями, ни организаторскими способностями.
Недоброжелатели критиковали Макарова за излишнюю, по их мнению, смелость, чрезмерную инициативу. Однако теперь, когда от событий тех дней нас отделяет много десятилетий, можно уверенно сказать, что внимание адмирала было направлено на главное — повышение боеготовности флота. Он разработал правила входа и выхода больших кораблей и миноносцев из внутреннего бассейна Порт-Артура. Под его руководством была создана новая диспозиция для стоянки на внешнем рейде. На кораблях вводились специальные наблюдатели за падением снарядов. Для корректировки стрельбы боевые посты рекомендовалось оборудовать переговорными трубами.
В отличие от адмирала Старка новый командующий хорошо понимал, что японское командование будет и впредь пытаться заградить вход во внутренний бассейн Порт-Артура. Поэтому необходимы были срочные меры, чтобы воспрепятствовать новой вражеской операции. Штаб флота под руководством командующего разработал план активных действий. Мероприятия адмирала Макарова и его энергия вселяли уверенность в личный состав. Уже первые боевые действия после его приезда становятся более решительными.
26 февраля (10 марта) под командованием капитана 1-го ранга Н.Н. Матусевича и капитана 2-го ранга Ф.Э. Боссе два отряда миноносцев в составе миноносцев «Выносливый», «Властный», «Внимательный» и «Бесстрашный» вышли в море на разведку. Первый отряд направился в Ляодунский залив, второй — к островам Эллиот.
