(((4.1) выполнение работ (оказание услуг) казенными учреждениями, а также бюджетными и автономными учреждениями в рамках государственного (муниципального) задания, источником финансового обеспечения которого является субсидия из соответствующего бюджета бюджетной системы Российской Федерации;
))) 01.01.2012 г. – Федеральный закон от 18.07.2011 N 239-ФЗ – с 1 января 2012 года не признаются объектом налогообложения выполнение всех работ (оказание услуг) казенными учреждениями, а также бюджетными и автономными учреждениями но только в рамках государственного (муниципального) задания, источником финансового обеспечения которого является субсидия из соответствующего бюджета бюджетной системы Российской Федерации, что снижает размер субсидий. При этом нельзя забывать, что в соответствии со статьей 170 НК РФ суммы налога, ранее принятые к вычету подлежат восстановлению налогоплательщиком при дальнейшем использовании таких товаров (работ, услуг), в том числе основных средств и нематериальных активов, и имущественных прав для осуществления операций по реализации, которая не признаются реализацией товаров (работ, услуг) в соответствии с пунктом 2 статьи 146 НК РФ. Восстановление сумм налога производится в том налоговом периоде, в котором товары (работы, услуги), в том числе основные средства и нематериальные активы, и имущественные права начинают использоваться налогоплательщиком для осуществления этих операций, то есть в 1 квартале 2012 года. А в случае получения учреждением субсидий из федерального бюджета на возмещение затрат, связанных с оплатой приобретенных товаров (работ, услуг), с учетом НДС, восстановление сумм налога производится в том налоговом периоде, в котором получены суммы предоставляемых субсидий. Суммы налога, подлежащие восстановлению, не включаются в стоимость указанных товаров (работ, услуг), в том числе основных средств и нематериальных активов, имущественных прав, а учитываются в составе прочих расходов. Суммы налога, предъявленные учреждению при проведении подрядчиками капитального строительства объектов недвижимости или при приобретении недвижимого имущества, если с момента ввода в эксплуатацию у данного налогоплательщика прошло менее 15 лет подлежат восстановлению в течение десяти лет начиная с 2012 года исходя из доли освобождения в общей реализации. (статья 146 НК РФ пункт 2 подпункт 4.1)
! Согласно п. 1 ст. 146 Налогового кодекса Российской Федерации объектом налогообложения налогом на добавленную стоимость признаются операции по реализации товаров (работ, услуг) на территории Российской Федерации независимо от источника финансирования. В связи с этим услуги, оказываемые государственными (муниципальными) учреждениями в рамках государственного (муниципального) задания, оплаченные за счет субсидий, подлежат налогообложению налогом на добавленную стоимость в общеустановленном порядке. Одновременно сообщается, что в соответствии с Федеральным законом от 18.07.2011 N 239-ФЗ "О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в связи с совершенствованием правового положения автономных учреждений" с 1 января 2012 г. выполнение работ (оказание услуг) бюджетными и автономными учреждениями в рамках государственного (муниципального) заказа, источником финансового обеспечения которого является субсидия из соответствующего бюджета бюджетной системы Российской Федерации, не является объектом налогообложения налогом на добавленную стоимость.
(Письмо Минфина РФ от 27.07.2011 N 03-07-11/197)
! Согласно пункту 1 статьи 6 Федерального закона N 239-ФЗ пункт 1 статьи 2 данного Федерального закона вступает в силу с 1 января 2012 года. Следовательно, налог на добавленную стоимость не исчисляется по работам (услугам), выполненным (оказанным) начиная с 1 января 2012 года казенными учреждениями, а также бюджетными и автономными учреждениями в рамках государственного (муниципального) задания, источником финансового обеспечения которого является субсидия из соответствующего бюджета бюджетной системы Российской Федерации.
(Письмо ФНС РФ от 07.10.2011 N АС-4-3/16572@ "Об изменениях и дополнениях статей 146 и 149 Налогового кодекса Российской Федерации")