Структурно истребители входили в состав истребительных авиационных полков (иап), которые до конца 1970-х гг. могли сводиться в истребительные авиационные дивизии (иад), а еще ранее - в состав истребительных авиационных корпусов и даже армий. По состоянию на середину 1990 г. иап входили в состав дивизий и корпусов ПВО отдельных армий ПВО (ОА ПВО), коих в войсках ПВО страны имелось 9, а также Московского округа ПВО (МО ПВО). В их структуре, кроме иап, имелись транспортные, испытательные и учебные авиачасти. Первые и вторые из них обеспечивали перевозки и проведение испытаний в интересах войск ПВО страны, третьи готовили и переучивали летный состав. Имелась даже одна авиадивизия - 60-я смешанная испытательная (спад).
Что касается транспортников, то авиационные части (осап, отап) и подразделения (осаэ, отаэ) приписывались к штабам отдельных армий ПВО (например, 223-я осаэ из состава 8-й ОА, Жуляны). Так, осаэ включали в себя, в основном, отряд самолетов Ан-24/26 и один-два отряда вертолетов Ми-8. Иногда таких подразделений в ОА было по два, как например, в 19-й ОА ПВО.
Кроме того, учитывая значительную прикрываемую площадь, а также необходимость усиления борьбы с низковысотными малоскоростными целями, в состав армий вводили отдельные вертолетные эскадрильи и отряды, иногда включавшие и вертолеты Ми-24 (например, 384-я овэ 6-й ОА ПВО).
Штабам корпусов, а также отдельных дивизий в составе войск ПВО также придавались авиационные подразделения - отдельные авиационные отряды, которые, как правило, имели в своем составе вертолеты Ми-8 (иногда - Ми-26).
| Части и подразделения ПВО непосредственного подчинения | ||||||||||
| 144 | ап ДРЛО | Печора | А-50 | - | - | - | - | |||
| 165 | осап | Карась (Эмба) | Ан-12 | Ан-26 | Ми-8 | Ла-17 | МиГ-21 | Су-17М | - | |
| 60 спад | 678 | гисап | Камбала(Сарышаган) | Ту-16Р | Миг-21 Р | МиГ-23 | Су-24МР | Ла-17 | - | |
| 60 спад | 679 | оитап | Камбала(Сарышаган) | Ан-12 | Ан-26 | Ан-24 | Ми-8 | Ми-6 | - | |
| ЦПЛС | 27 | гиап | Учарал | МиГ-23 | - | - | - | |||
| ЦПЛС | 412 | иап | Домбаровский | МиГ-23 | - | - | - | - | ||
| ЦПЛС | 849 | иап | Купино | МиГ-23 | - | - | - | - | - | - |
| 18ЦБППВО | б/н | ииап | Красноводск | МиГ-25П | МиГ-23 | Ла-17 | - | - | - | |
| 148 ЦБП | 594 | уиап | Саваслейка | - | МиГ-31 | МиГ-23 | - | - | - | |
| 148 ЦБП | 615 | уиап | Саваслейка | Су-27 | МиГ-25П | - | - | - | - | - |
| 148 ЦБП | 142 | отао | Саваслейка | Ан-26 | Ми-8 | - | - | - | - | - |
| 116 УЦБП | б/н | уап | Астрахань (Приволжский) | МиГ-29 | МиГ-23 | Ла-17 | - | - | - | |
| 978 | отап | Клин | Ил-76 | Ан-12 | Ан-26 | Ан-24 | Ту-134 | Ту-154 | Ми-8 | |
| - | - | - | Ан-72 | Ту-134Ш | - | - | - | - | - | |
| 235 | осаэ | Капустин Яр (Знамянск) | Ан-26 | Ан-24 | Ми-8 | - | - | - | ||
| 18 | оаэ | Витебск(Северный) | А-50 | Ил-76 | - | - | - | - | ||
| - | оаэ | Укурей | А-50 | Ил-76 | - | - | - | - | - | |
Проходили службу в составе авиации ПВО и «представители» ДА. Так, в начале 1980-х гг. это были отдельные эскадрильи Ту-16, предназначавшиеся для подыгрыша истребительной авиации, а впоследствии - 678-й гвардейский Краснознаменный смешанный авиационный испытательный полк (Са- ры-Шаган, Казахстан), в составе которого находились самолеты Ту-16 и Су-24МР. Причем, первые из них использовались и для запусков БП/1А, а также - в качестве радиоуправляемых мишеней, которые и уничтожали зенитно-ракетные войска.
Авиация ПВО имела в своем составе, кроме «стандартных представителей» ТрА (самолетов Ан-24/26 и вертолетов Ми-8), самолеты Ил-76 (978-й овтап, Клин) и вертолеты Ми-26, входившие в состав 141-го ово (Марнеу- ли), 50-й отаэ (Норильск), 144-го отао (Чита). В составе 185-го овсо (Крымск) эксплуатировались вертолеты Ка-27ПС. Еще одним примером «нестандартного применения» конкретного типа самолета стало наличие в составе авиации ПВО эскадрилий фронтовых истребителей МиГ-29 (116-й УЦ и 18-й ЦБП ПВО), которые, согласно «союзным планам» на будущее, предполагалось принять на вооружение авиации ПВО.
Командовал авиацией войск ПВО страны с 1987 г. генерал-лейтенант авиации В.И. Андреев, которого после освобождения с должности в июле 1990 г. сменил генерал-лейтенант авиации О.В. Анисимов. Впрочем, первый из них вернулся на свою должность после августовских событий 1991 г. и занимал ее до 1998 г., дослужившись до звания генерал-полковника.
