В целом заявки на участие в ССВ подали 1140 коммерческих банков из 1183 кредитных организаций, имеющих лицензии на работу с физическими лицами. Срок приема заявок заканчивался 27 июня 2004 года. Решения о вхождении банков в ССВ принимались Комитетом банковского надзора, который возглавлял первый зампред Центрального банка А.А.Козлов. Документом, регламентирующим этот процесс, являлось Указание ЦБ РФ N 1379-У от 01.03.2004 года "Об оценке финансовой устойчивости банка в целях признания ее достаточной для участия в системе страхования вкладов". Так как в данном Указании допускалось применение мотивированного экспертного суждения со стороны органов надзора о надежности банка, то это сразу стало поводом для недовольства отдельных представителей банковского и экспертного сообщества. Камнем преткновения также стали требования Центрального банка раскрыть реальных собственников кредитных организаций и в соответствии с международными стандартами финансовой отчетности осуществить переоценку капитала.
Новые "правила игры" в конечном итоге привели владельцев банков к необходимости пересмотра отношения к принадлежащим им активам, как в финансовой, так и в промышленной сфере. В результате часть банков сменили владельцев, часть — рыночную специализацию либо клиентскую политику. В конце 2003 года общественность узнала об истинных владельцах некоторых крупных банков. Например, выяснилось, что более 50 % акций "Конверсбанка" принадлежит председателю совета директоров "Конверс-групп" Владимиру Антонову, одна треть акций "Сибакадембанка" находится в собственности председателя Совета директоров Игоря Кима, а банками "Глобэкс" и "АвтоВАЗбанк" через дружественные структуры владеет президент банка "Глобэкс" Анатолий Мотылев.
По версии Центрального банка заявления коммерческих банков на вхождение ССВ рассматривались в очередности их поступления. При этом между Центральным банком и Ассоциацией российских банков была достигнута договоренность о том, чтобы банки, после того, как получат положительное решение, были корректны по отношению к своим коллегам, которые ждали своей очереди на рассмотрение заявлений, и не использовали свое вступление в ССВ в рекламных целях. Первый список банков, вошедших в ССВ, Центральный банк опубликовал 21 сентября 2004 года. В него вошли 26 кредитных организаций, большинство из которых являлись региональными. Список пополнялся почти еженедельно. Всем банкам, которые в него включались, Агентство страхования вкладов (АСВ), направляло комплект документов о порядке и правилах работы ССВ, а также образец специального знака "Вклады застрахованы" — для того, чтобы банк, прошедший чистилище инспекционной проверки, мог вывесить его в местах обслуживания своих клиентов. Официально первый этап приема банков в ССВ начался 21 сентября 2004 года и завершился 24 марта 2005 года.
На первом этапе в ССВ вошли 827 банков, в которых сконцентрировано около 98 % всех вкладов населения. Банки, не вошедшие в ССВ, сохранили право привлекать вклады населения до 27 сентября 2005 года. Некоторые из них рассчитывали на то, чтобы до 27 апреля 2005 года (последний день подачи заявлений) пройти повторную проверку. "Российский банк развития" (РосБР) и две "дочки" иностранных банков — "БНП Париба" и "ВестЛБ Восток", которые и раньше не работали с населением, приглашение к участию в ССВ проигнорировали, а банки "Первое ОВК" и "Центральное ОВК" свои заявления отозвали, в связи с продажей своего бизнеса ОАО АКБ "Росбанк". С июля 2005 года начался второй этап приема в ССВ, который прошли еще 103 банка. При этом у банков, не вошедших в ССВ, лицензия на работу с физическими лицами была аннулирована. Обращаться за ней в ЦБ повторно такие банки, а также вновь образуемые, могли лишь через два года.
10 июня 2005 года Президент В.В.Путин провел рабочую встречу с Председателем Центрального банка С.М.Игнатьевым. Стенограмма беседы была опубликована на сайте Президента РФ. В беседе, в частности были затронуты вопросы ССВ:
ИГНАТЬЕВ: Мы закончили первый этап приема банков в систему страхования вкладов. Он был завершен еще в марте. В систему страхования пока вошли 827 банков, но они концентрируют примерно 98 процентов всех вкладов населения в банковской системе.
ПУТИН: 827 — большое количество.
ИГНАТЬЕВ: Еще примерно 260 хотят войти. Второй этап, который завершится в конце сентября, как раз и будет посвящен отбору этой группы банков в систему. Я считаю, что проведена очень большая и полезная работа.
ПУТИН: Банки не чувствуют какой-то дискриминации при решении этой задачи — второго сорта, первого сорта? Не возникает такой ситуации?
