Принц Даккар получает от Братьев описание и часть чертежей подводной лодки (происхождение неизвестно, по некоторым данным — разработка Леонардо да Винчи или его учеников). Молодой учёный погружается в работу над проектом, и, благодаря финансовой и организационной помощи Братства, завершает его в кратчайшие сроки.
Бунделкханд полностью принадлежит англичанам. Генерал-губернатор Индии Джеймс Дальхузи смещает местных князей и аннексирует их владения. Принц Даккар получает информацию о том, что его возвращение в Индию крайне нежелательно и может иметь самые плохие последствия для его семьи и для него лично.
Подводная лодка, получившая название «Наутилус», спущена на воду.
Первый спуск к подводному вулкану. Братьям известен факт существования подводных вулканов, и они предполагают искать симпатическую субстанцию на их склонах.
Погружение неудачное, субстанция не найдена, «Наутилус» повреждён и едва не погиб.
В Нанте рождается Жюль Габриэль Верн, будущий знаменитый писатель, сыгравший немалую роль в сокрытии и искажении некоторых операций Досточтимой Ложи.
Принц Даккар исследует подводный мир в поисках «субстанции» и находит её в открытых им «чёрных курильщиках» (подводные вулканы оказались и бесполезны в этом плане, и попросту опасны).
Братья ведут исследования субстанции, но без прорывных результатов. Подтверждаются сведения, почерпнутые из античных источников и Салернского кодекса — она продлевает жизнь, «перенося молодость других существ», заживляет раны (при наложении поверх кожи животных) и является эффективным средством против ряда инфекционных заболеваний.
На дне Атлантики обнаруживаются следы цивилизации атлантов, в том числе остатки подводных баз.
Принц спасает молодого хирурга Моро, чуть не погибшего во время кораблекрушения. Молодой человек, весьма талантливый и с учёной степенью, но с ужасным характером (в частности, он ненавидел своё
вычурное имя и ссорился с людьми, которые его использовали), успел насмерть разругаться с семьёй и коллегами. Корабль вёз его во Францию, где он рассчитывал попытать счастья.
Следующие шесть лет Моро, присоединившийся к принцу, с энтузиазмом исследует биоту «чёрных курильщиков». Именно ему удаётся выделить т. н. «нейтральный векторный агент» и разработать технологию направленного переноса генов.
На дне Карибского моря под слоем осадков обнаружено огромное сооружение, построенное, вероятнее всего, атлантами. Больше всего оно напоминает гигантскую пушку со стволом пятиметрового диаметра и трёхкилометровой длины из неизвестного материала.
Ссора принца с Братьями из-за убийства военными его родных в Индии. Принц планирует перейти к партизанской войне против британских колонизаторов, но отношения с Братьями всё же не прерываются — параллельно он продолжает поставлять им субстанцию.
Моро высаживается на будущем «острове Линкольна» и оборудует для принца наземную базу. Тогда же начинаются опыты Моро по конструированию гомункулусов из компонентов, взятых у различных животных.
Маркиз Дальхузи аннексирует княжество Ауд под предлогом «плохого управления» последнего наваба княжества Варжид Али Шаха. Это вызывает всеобщее возмущение.
Принц Даккар тайно возвращается в Индию.
В городе Смилян Австрийской Империи рождается Никола Тесла.
Восстание сипаев. Принц Даккар принимает в нём активное участие в качестве штабиста — планировщика операций.
Братья организуют вторую экспедицию в Исландию (описанную в романе Жюля Верна «Путешествие к центру Земли»). Они вроде бы находят независимый от Немо источник субстанции, однако найденная ими подземная вулканическая система гибнет во время извержения, да и образцов субстанции для перепроверки экспедиция доставить не сумела.
В отсутствие принца Даккара Братство отправляет Наутилус (под временным командованием брата Барбикена, уроженца Балтимора) исследовать обнаруженную в Карибском море установку атлантов.
Удаётся установить назначение и принципы действия устройства. Это space gun, орбитальная пушка подводного базирования. Смысл размещения ствола под водой — избежать его деформации под собственным весом (что на суше было бы неизбежно) и сделать возможным наведение. Пушка в рабочем состоянии должна плавать в воде под заранее заданным углом к горизонту, с дульным срезом в надводном положении. Подъём пушки осуществлялся понтонной системой, разгон снаряда в стволе — непонятными тогдашней науке устройствами, каким-то образом связанными с электричеством. Судя по всему, система обеспечивала постоянное ускорение на протяжении трёхкилометрового участка, что позволяло избежать критических перегрузок, разрушающих снаряд и его содержимое.
В дальнейшем в документах Братства найденное орудие именуется Карибской Колумбиадой.