Поданным MLVA-анализа, штаммы В. anthracis делят на три линии (А, В, С), среди которых A-клада (линия, группа, кластер) является наиболее значимой (до 90 % всех штаммов) и имеет глобальное распространение. К линии В относятся в разных исследованиях обычно менее 12 % изолятов. Встречается только в некоторых географических регионах. Ее подразделяют еще на две группы, В1 и В2. На Юге Африки 93 % изолятов В. anthracis представлены группой В1, где линия сосуществует со штаммами A-клады. Штаммы В. anthracis группы В2 встречаются в Швейцарии, странах Южной и Восточной Европы. Штаммы линии А подразделяют еще на 4 группы (кластера). Изоляты кластера А1 доминируют на западе Северной Америки и в Канаде (генотипы 1 и 3), встречаются в Южном Техасе (генотип 6). А2-ветвь встречается среди отдельных изолятов, привезенных из Пакистана. АЗ- кластер — самый распространенный из всех известных (до 58 % изолятов). Вызывает вспышки сибирской язвы на юге Африки (генотипы 30, 40, 67); в Австралии (штат Виктория, генотип 66), в Турции (генотип 35). Этой ветви соответствуют v звестные вакцинные штаммы V770-NPR (генотипы 45,46 и 49) и Стерн (генотипы 59 и 61). Ames, любимый штамм американских военных биологов (генотип 62), находится в АЗ.Ь-кластере. Кластер А4 недостаточно изучен. С-клада встречается редко и недостаточно изучена. Два независимых изолята были найдены в Соединенных Штатах (Keim P. et al., 2002, 200°). Кластерная принадлежность штаммов, вызвавших на одной территории сибирскую язву у людей и животных, может сильно отличаться. Например, в Швейцарии в начале 1980-х гг. вспышки сибирской язвы среди животных вызывали штаммы В. anthracis, принадлежащие к кластеру В2, среди людей — штаммы кластера А4. Это было связано с разным происхождением источника их заражения сибирской язвой: животные инфицировались из местных очагов, а люди — во время переработки кожаного сырья, завезенного из Индии (Pilo P. et al., 2008).
Показана территориальная и временная зависимость выделения из образцов штаммов В. anthracis различных линий. 30-летнее исследование молекулярных отличий штаммов сибиреязвенного микроба, выделенных в Национальном парке Крюгера (Kruger National Park, ЮАР), позволило установить ряд любопытных закономерностей (рис. 3.4).
Рис. 3.4. Временные и территориальные зависимости выделения образцов В. anthracis в национальном парке Крюгера поданным MLVA-анализа. А. Локализация изолятов А- и В-линий: а — карта отбора индивидуальных изолятов; б — карта распределения изолятов по линиям. Б. Распределение линий изолятов по годам. В скобках количество изолятов в абсолютных цифрах. В. Связь линий изолятов с pH почвы (I) и наличием в ней солей кальция (II). По К. L. Smith et al. (2000)
Национальный парк Крюгера расположен на востоке Трансвааля между реками Лимпопо и Крокодиловая. На востоке парк граничит с Мозамбиком. Общая протяженность парка с севера на юг составляет 340 км. Три основные части парка (северная, центральная и южная) сформированы реками Олифанте и Саби. Климат на территории парка субтропический, сезон дождей обычно с октября по март (включительно) Сибирская язва поражает преимущественно копытных травоядных обитателей парка (Smith К. L. et al., 2000).