Продолжив поход, Лют добился еще одного успеха. 11 мая U-9 потопила два парохода: эстонский «Вийю» (1 908 БРТ) и английский «Тринга» (1 930 БРТ). Вечером 15 мая лодка вернулась в Вильгельмсхафен, но перерыв между окончанием этого похода и началом следующего длился меньше суток. Пополнив запасы топлива, торпед и провизии, в 15:00 следующего дня Лют снова вышел в море. Обстановка того требовала, так как события на суше развивались молниеносно. 20 мая Лют получил радиограмму о захвате Антверпена, крупнейшего порта Бельгии, что означало начало бегства судов, стоявших в ее портах, в Англию.
U-9 Люта в Вильгельмсхафене 15 мая 1940 года. Над лодкой развеваются три вымпела: два потопленных судна и подлодка «Дорис». Это самый успешный поход лодки. Любопытны очертания эмблемы на рубке – вероятно, крест снят, и видно только основание его крепления
Но вольной охоте на них мешали два обстоятельства: вражеские эсминцы и дизели U-9, дававшие сбои в работе. 23 мая Люту посчастливилось найти легкую цель в виде судна, которое тащил за собой в сторону английского берега буксир. В 12:54 лодка выпустила две торпеды, которые раскололи пароход пополам. Позже, когда экипаж покинул судно и был подобран буксирами, U-9 осмотрели пустые шлюпки, где немцы нашли документы бельгийского солдата. Вкупе с тем, что судно буксировали в Англию, это позволило Люту считать, что он потопил важный войсковой транспорт. На самом же деле он торпедировал бывшее латвийское судно «Сигурд Фаульбаум», не имевшее хода, по причине чего англичане решили буксирами перетащить его в Англию, нагрузив 1 000 тонн различных военных грузов, которые они пытались эвакуировать из Бельгии. По этой причине догадку Люта можно считать недалекой от истины.
24 мая U-9 взяла курс к английскому берегу, где в три часа утра следующего дня обнаружила и неудачно попыталась атаковать три английских эсминца (HMS Jackal, HMS Javelin и HMS Gallant), которые, в свою очередь, заметили лодку и делали ее мишенью для своих глубинных бомб на протяжении 21 часа. U-9 сильно досталось, все, что могло повредиться, было повреждено. Субмарине чудом удалось уйти и доковылять до базы, где ее встретил Дениц, мысленно уже похоронивший Люта и его экипаж.
После постановки лодки на ремонт было признано нецелесообразным использовать ее в боевых действиях. Поэтому 11 июня 1940 года Лют сдал U-9 обер-лейтенанту цур зее Вольфгангу Кауфману, а сам получил назначение на новую лодку. Впоследствии он командовал еще тремя субмаринами и стал прославленным подводным асом, уступив в потопленном тоннаже только Отто Кречмеру. Лют пережил войну, но погиб в результате несчастного случая 13 мая 1945 года.
После завершения ремонта U-9 была отправлена на Балтику, где вошла в состав одной из учебных флотилий и использовалась как учебная лодка для тренировки будущих экипажей боевых подлодок. Возможно, крестоносная субмарина так до конца войны и оставалась бы учебной, если бы не нападение Германии на Советский Союз.
После успешных боевых действий в начале Второй мировой под командованием Вольфганга Люта подводная лодка U-9 была переквалифицирована в учебную. Вероятно, в этом качестве она и дотянула бы до окончания войны, если бы не нападение Германии на СССР. Для относительно небольшого черноморского театра военных действий маленькая «двойка» была вполне подходящим оружием, и лодку вновь «призвали». Дальнейшая ее судьба сложилась довольно неожиданно.
Начало Великой Отечественной войны ознаменовало новый виток в судьбе немецкой подлодки U-9. С нападением 22 июня 1941 года Германии на СССР немецкие ВМС получили еще три морских театра военных действий, в том числе и на Черном море. Однако там изначально не имелось каких-либо немецких кораблей, за исключением нескольких речных тральщиков типа FR Дунайской флотилии, поэтому в первые месяцы войны против советского флота действовали только румынские ВМС, численность, подготовка и активность которых оставляли желать лучшего.
Переброска кораблей с других театров морем была невозможна, так как Турция не собиралась нарушать нейтралитет и открывать черноморские проливы для прохода военных кораблей воюющих держав. Попытка договориться с Турцией о покупке у нее подводных лодок успехом также не увенчалась. Немцам ничего не оставалось, как пойти на весьма необычный шаг, а именно произвести переброску кораблей небольшого водоизмещения на Черное море по суше и рекам.
