Во время службы в армии он окончательно становится на путь революционной борьбы с царизмом. В 1905 году Александра Александровича арестовали за организацию выступления солдат против издевательств над ними офицеров, держали его в крепости Зергеж (Польша) до 1906 года. Затем А. А. Емельянов возвращается в Кирсанов и работает на железной дороге, а потом переезжает в Курск и устраивается рабочим на одну из фабрик. Все это время, по заданию партийной организации, он ведет разъяснительную работу среди рабочих, призывает их к борьбе против заводчиков и фабрикантов, за экономические и политические права.
Грянула империалистическая война в 1914 году. Емельянов вновь на фронте. Там он с помощью и под руководством большевиков активно включается в революционную подпольную работу среди солдат, помогает им понять, кому нужна эта война.
В ноябре 1917 года Емельянов был принят в партию большевиков. Его направляют членом Военного совета Курского укрепрайона и чрезвычайным уполномоченным 7-й армии. Здесь Александр Александрович показал незаурядные организаторские способности. Эти качества, сочетаемые с общей образованностью, принципиальностью, выдержкой и беспредельной честностью, сыграли свою роль, когда в марте 1919 года принимается решение о направлении его на работу в органы ВЧК. Сначала А. А. Емельянов назначается председателем Курской губЧК, а в декабре 1920 года — в ДонЧК.
Работал А. А. Емельянов в ДонЧК первое время заместителем председателя, а затем и председателем. Александр Александрович много времени уделял воспитанию сотрудников, учил их быть принципиальными, смелыми, честными и беспредельно преданными партии и трудовому народу. Все это происходило одновременно с активной борьбой против политического и уголовного бандитизма. Борьба эта в условиях разрухи и голода была неимоверно трудной.
В мае 1921 года на территории Кубани отрядами чекистов совместно с войсками Красной Армии была проведена боевая операция по разгрому бело-зеленых банд, возглавляемых полковником Жуковым, который прибыл на Кубань по личному поручению Врангеля с целью объединить все бандитские группы и подчинить их общему командованию. Жукову удалось объединить до десятка банд. Свой штаб он расположил в станицах Уманской и Новоминской.
ДонЧК от имени Советской власти неоднократно обращалась к бело-зеленым бандам с призывом сложить оружие, обещала полное помилование. Но призывы не имели успеха. Банды продолжали терроризировать мирное население. Тогда ДонЧК и войсковые части провели свою операцию, в результате чего четверо главарей банд были убиты, в их числе и Жуков, остальные взяты в плен. Пленены были и многие рядовые бандиты. Некоторым из них удалось уйти в камыши. После поимки главарей в стансоветы начался приток групп и отдельных лиц с повинной.
Однако положение в Донской области все ухудшалось. Неурожай в Поволжье, на Дону и в других местах к осени 1921 года вызвал жесточайший голод. Зарубежные капиталисты и внутренняя контрреволюция пытались использовать тяжелейшее положение молодой Советской Республики и вновь поднять вооруженный поход против народной власти.
Партия призывала всех тружеников стоять на страже революции и помнить, что лишний оторванный пуд хлеба от государственных запасов усиливает разруху и несет голодную смерть трудящимся. Несмотря на это, хищение государственных запасов приняло массовый характер. Ежедневно растаскивались сотни и тысячи пудов продовольствия. Органам государственной безопасности приходилось усиливать меры борьбы с хищением, взяточничеством и бесхозяйственностью, карая преступников наравне с контрреволюционерами.
Вся работа по борьбе с уголовным бандитизмом проводилась только под руководством ДонЧК, а судебное разбирательство этих дел возлагалось на специально созданную в декабре 1921 года чрезвычайную сессию реввоентрибунала СКВО и 1-й Конной армии, куда вошел один из членов коллегии ДонЧК.
Аппаратом ДонЧК была раскрыта организация расхитителей на 1-й государственной заготовительной фабрике в городе Ростове-на-Дону, где под руководством предфабкома Тересфельда Муз, Данишевский, Кузнецов, Гольдман и другие расхищали товары и продукты. Каждый член организации за вынос продукции с фабрики должен был дать секретарю фабкома 10 тысяч рублей, а контролеру-обыщику — 5—10 тысяч рублей. Заготовщики сами присваивали товар, за что платили секретарю фабкома 25 тысяч рублей. Материалы этого дела также были направлены на рассмотрение чрезвычайной сессии ревтрибунала СКВО и 1-й Конной армии.
