Эта поправка вызвала крайне негативную реакцию Венецианской комиссии, которая отметила в своем заключении, что «краеугольным камнем правового государства является разделение властей. В стране с формой правления в виде президентской (а иногда полупрезидентской) республики существует тенденция концентрации властных полномочий в руках президента, в то время как соответствующие полномочия законодательной и судебной ветвей власти существенно слабее. Следовательно, регулярная смена режима посредством выборов является надлежащим способом предотвращения чрезмерной концентрации власти в руках Президента» (ст. 10)[229]. Венецианская комиссия отметила также, что Азербайджан, Конституция которого устанавливает форму правления в виде президентской республики, несомненно является страной, где президент сконцентрировал в своих руках весьма широкие полномочия, при этом система сдержек и противовесов представлена в крайне ограниченном формате. Следовательно, было совершенно логично, что изначальная редакция Конституции Азербайджана устанавливала ограничение в виде двух президентских сроков (ст. 13).
Тенденция нетерпимости к инакомыслию начала особенно ярко проявляться с 2011 года, когда притеснение властями молодежи и представителей оппозиции, а также усиление ограничительных мер, налагаемых на свободу вероисповедания, начали обретать регулярный характер. Отмечая тот факт, что интенсификация преследования инакомыслия постепенно превращается в нормальный modus operandi, Economist Intelligence Unit[230] прогнозирует дальнейшие ограничения на свободу вероисповедания. Одновременно с этим утвердилась практика нарушения государством прав собственности, в особенности в Баку, где ряд жителей были насильно выселены из своих домов, которые были затем разрушены без каких-либо законных оснований.
Начиная с 2000 года, Азербайджан начал постепенные преобразования в судебной сфере. Главными целями начальной фазы реформ были модернизация нормативно-правовой базы, на основании которой функционировала система правосудия, повышение профессионального уровня судей и введение прозрачной и основанной на заслугах системы рекрутмента судейских кадров. Помимо этого, в качестве приоритетных задач были определены совершенствование кадровой оснащенности и технологической инфраструктуры судов, а также улучшение доступа к правосудию. Достижения в сфере трансформации судебной системы Азербайджана воспринимаются по-разному. С точки зрения экспертов Всемирного банка, Азербайджан достиг определенных успехов в этой сфере. Были приняты новые Уголовный, Уголовно-процессуальный, Гражданский и Гражданско-процессуальный кодексы, разработанные с учетом наилучших зарубежных практик. Реформы в сфере материального и процессуального права считаются проведенными в рамках выполнения Азербайджаном обязательств, проистекающих из его членства в Совете Европы (с 2001 года). В 2000 году в Баку состоялись первые проходившие на конкурсной основе экзамены для кандидатов на судейские должности, находившиеся в фокусе внимания средств массовой информации и международных наблюдателей. Программа дальнейшей реформы в судебной сфере была сформулирована в Указе президента «О развитии институтов правосудия» (2006 год). В документе были установлены необходимость учреждения новых судов, модернизации существующих судов, системы подготовки судейских кадров и оценки их профессиональной деятельности, применения новых технологий, повышения эффективности национальной судебной системы, совершенствования системы юридической помощи и повышения доверия населения к судам и судьям. В качестве достоинства азербайджанской судебной реформы эксперты Всемирного банка отметили внедрение объективной, компьютеризованной и транспарентной системы тестирования для отбора нового поколения судей. В целях повышения статуса и престижа судейской профессии, а также привлечения высококвалифицированных претендентов на судейские должности зарплаты судей были увеличены в 30 раз начиная с 2000 года. К изменениям структурно-организационного характера следует отнести учреждение двадцати новых региональных судов, а также создание региональных судов по особо тяжким делам и административных судов. Полномочиями по управлению судебной системой, повышению судейской независимости и решению дисциплинарных вопросов был облечен новый независимый орган, Судебно-правовой совет, в состав которого вошли судьи, а также лица, назначаемые Генеральной прокуратурой, Президиумом коллегии адвокатов, Милли Меджлисом и «соответствующим органом исполнительной власти» (ст. 6 закона Азербайджанской Республики «О Судебно-правовом совете» от 28.12.2004 г. № 818 ПГ). В последние годы особую важность приобрела антикоррупционная компонента деятельности Судебно-правового совета, заключающаяся в возбуждении дисциплинарного производства по результатам мониторингов, проводившихся в судах в связи с обеспечением прав граждан, в том числе и их защиты от коррупции.