2-й отдел Директората региональных контролеров — европейский. Традиционно специализируется на европейских странах и осуществляет координацию разведывательной деятельности против союзников по ЕС. Его сотрудники работают под дипломатическими прикрытиями в британских посольствах в Германии, а также во Франции, Италии, Испании, Швейцарии. В странах, являющихся сферой деятельности 2-го отдела, оперативная работа традиционно строится в контакте с местными службами. Формальное взаимодействие с европейскими партнерами, особенно с разведками стран НАТО, МИ-6 осуществляет по каналам связи 2-го отдела с европейским штабом ЦРУ, расположенным во Франкфурте-на-Майне. Внешняя сторона сотрудничества натовских разведок не является препятствием для ведения ими вербовочной работы с целью перехвата источников информации. Сотрудники 2-го отдела, в свою очередь, не стесняются осуществлять прямые разведывательные операции против европейских партнеров Великобритании.
Штаб-квартира британской разведки МИ-6
3-й отдел Директората региональных контролеров — «группа русская орбита». Был сформирован еще в середине 20-х годов прошлого века. В период существования Советского Союза он отвечал за разработку объектов стран Восточного блока («Группа русской орбиты»). Отдел должен был обеспечивать координацию деятельности на этом направлении всех национальных (правительственных) учреждений и всех подразделений разведки. Особо тесный контакт поддерживался с департаментом, отвечавшим в МИ-6 за выработку заданий. После окончания «холодной войны» отдел продолжает функционировать. В 1996 году в ходе парламентских дебатов состоялось обсуждение вопроса о взаимоотношениях с Россией и роли английских спецслужб в этом процессе. Подчеркивалось, в частности, что «Англия не может позволить себе роскошь быть в неведении относительно распространения ядерного, бактериологического и химического оружия с учетом ситуации в России, а также ее взаимоотношений со странами СНГ, Китаем и некоторыми другими государствами Европы и Ближнего Востока».
5-й отдел Директората региональных контролеров — ближневосточный. Его резидентуры действуют в Израиле, Сирии, Турции, Иране, Ливане, на Кипре и в ряде других стран. Долгое время центром напряженности на Ближнем Востоке являлся Ливан. В этой связи в Бейруте размещалась региональная резидентура МИ-6, с позиций которой осуществлялось руководство деятельностью агентурных сетей практически во всех арабских странах. Основная направленность подрывных операций МИ-6 носила антиегипетский и антисирийский характер.
В оперативном обслуживании резидентуры находился Ближневосточный центр арабистики МИД Великобритании, расположенный в ливанском городе Шемлан, недалеко от Бейрута. Несмотря на то что иракская резидентура МИ-6 смогла своевременно выявить попытки Багдада приобрести химическое и биологическое оружие, на 5-й отдел тем не менее возлагают вину за то, что британские спецслужбы не смогли предсказать в конце 80-х годов прошлого века развитие событий в Персидском заливе. Доказательством неэффективности английской разведки оказалась ее неспособность своевременно сигнализировать о вступлении иракских войск в Кувейт, что нанесло немалый ущерб национальным интересам Великобритании и поставило под угрозу жизнь британских подданных. МИД проглядел подготовку к вторжению из-за стремления наладить отношения с Багдадом. Западные спецслужбы традиционно привыкли полагаться на сложную электронную технику, что в случае с вторжением Ирака в Кувейт оказалось недостаточным.
6-й отдел Директората региональных контролеров — дальневосточный. Наиболее активной сферой деятельности резидентур этого отдела являются Япония, Сингапур, Малайзия, Индонезия и Филиппины. Кроме того, спецслужбы Великобритании для решения проблем в данном регионе традиционно поддерживают контакты с соответствующими ведомствами Австралии, Новой Зеландии. МИ-6 стремится координировать свою деятельность с тайной полицией и разведслужбами Индонезии (БАКИН), Малайзии и Японии.
Штаб-квартира британского центра правительственной связи