В 1750 году Спиридов командовал «Невской флотилией», придворными яхтами. У него в подчинении находился участник Тихоокеанской экспедиции Семен Челюскин. В эту кампанию Спиридов поневоле ив раз наблюдал царственных особ — Елизавету, будущего императора Петра III, его жену Екатерину.
В очередную кампанию 1751 года Спиридов впервые начальствует — под его командой 10-пушечный бомбардирский корабль «Самсон».
Кампанию он заканчивает в чине капитан-лейтенанта и отправляется в Архангельск. Следующим летом возвращается в Кронштадт на 66-пушечном линейном корабле.
Весной 1754 года он уже капитан 3-го ранга и вскоре назначен членом комиссии «Для рассмотрения, регламента флота», а затем, как образцовый офицер, направлен а Морской шляхетный корпус. Здесь он служил вместе с Харитоном Лаптевым. Работая в комиссии, Спиридов совместно с капитан-командором Семеном Мордвиновым разработал новый свод Морских сигналов.
Начало войны с Пруссией, летом 1757 года, капитан 2-го ранга Спиридов встретил на мостике линейно-i’O корабля «Астрахань».
Объявляя войну, царский Манифест гласил:
По плану армия должна была направить свой главный удар на Кенигсберг и овладеть Восточной Пруссией. Особый отряд выделялся для занятия Мемеля.
Пруссаки, явно недооценив силы русских, вскоре поплатились за это. Русские войска и флот овладели Мемелем, пруссаки потерпели поражение под Грос-Егерсдорфе и стали спешно отступать. Главнокомандующий русской армией генерал-фельдмаршал Степан Федорович Апраксин, не в пример родителю, человек бесхарактерный и беспринципный, сделавший карьеру лишь благодаря придворным связям, вел двойную игру. Зная, что Елизавета Петровна давно недужит, он боялся рассердить бедующего императора Петра III слишком быстрым наступлением и оттягивал, как мог, преследование пруссаков. Более того, отвел вскоре войска к Мемелю, за что и был отстранен от командования и отдан под суд за измену. Сменивший его генерал-аншеф Фермор в дальнейшем, после взятия Кенигсберга, тоже действовал не лучшим образом.
