Другим важным направлением научной деятельности Андрея Юрьевича постепенно становится конфессионализация, под которой немецкие историки конца XX в. понимали воздействие лютеранского, кальвинистского и обновленного католического вероучений на все стороны жизни имперского общества, а также соседних европейских монархий в середине XVI–XVII вв. Речь шла о врастании религиозного опыта в сознание, право, быт и культуру всех сословий и социальных групп.
Проблемы имперского дворянства XVI–XVII вв. виделись историками рубежа XX–XXI вв. как совокупность социально-политических и конфессиональных аспектов, среди которых важнейшими были функции и итоги деятельности княжеской элиты как внутри отдельных территориальных государств, так и Империи в целом. Акцентировалась социальная, религиозная и культурная повседневность знати, ее связь с духовными практиками, многоукладностью позднесредневекового общества, а также роль дворянства в развитии реформационного движения.
В своей первой монографии – «Германия в эпоху религиозного раскола 1555–1648 гг.» – Андрей Юрьевич сумел дать читателю лаконичное, содержательное и законченное представление как о конфессионализации, так и о феномене имперского дворянства, подытожив все важнейшие достижения немецкой исторической науки второй половины XX в. В предисловии к этой книге автор выражает сожаление, что «свежий взгляд все еще остается недоступным русскоязычной публике, вынужденной питаться лишь старыми штампами и стереотипами из учебных пособий, сопоставляя их с очень редкими переводными работами» и называет своими главными задачами «отображение главных тенденций в социальной истории Германии от Аугсбургского мира до конца Тридцатилетней войны» и «желание ознакомить читателя с мнениями ведущих немецких экспертов по указанной теме»[1]. Открывает монографию анализ структур Империи и территориальных государств во второй половине XVI в. (а также накануне Тридцатилетней войны), Андрей Юрьевич описывает распространение конфессий в немецких землях Империи, их догматическое созидание и организацию церквей. Помимо этого, в работе представлена типология и портреты крупных немецких династов конфессиональной эпохи, охарактеризованы стиль правления и методы хозяйствования, система ценностей, воспитание и культура высшего и низшего немецкого дворянства. Завершает книгу блок параграфов, посвященных Тридцатилетней войне, ее причинам и поводам, ходу, итогам и последствиям, и в целом состоянию немецкого общества, его структур и институтов во второй половине XVII в.
Изучение имперских и территориальных структур власти и имперского дворянства продолжилось и в последующие годы: в монографии «Иоганн Георг I (1586–1656), курфюрст Саксонии. Власть и элита в конфессиональной Германии» Андрей Юрьевич не только представил портрет основного героя – современника Тридцатилетней войны и всех несчастий, которые она принесла Саксонии, но и охарактеризовал особенности немецкой княжеской педагогики и лютеранского благочестия конца XVI – начала XVII вв., устройство княжеского двора, структуры и повседневность региональной дворянской корпорации, а также в целом продемонстрировал роль Саксонии в Империи как до последнего лояльной Габсбургам «центристской» силы. Это единственная биография курфюрста Иоганна Георга I, написанная во второй половине XX – начале XXI вв. в духе новейших исторических исследований.
