Несмотря на то, что шансы короля и повстанцев примерно уравновешивались, губернаторы не принимали решительных мер, частично из-за отсутствия средств, частично в расчете на возможное соглашение. Один лишь коннетабль в начале октября стал стягивать войска для освобождения королевы Хуаны и для защиты совета. Адмирал завязал переговоры с хунтой, стремясь отговорить ее от намерения отстранить коннетабля от управления. Он призывал хунту к замирению страны и грозил в противном случае войной. Хунта отнеслась отрицательно к его предложениям. Вместо того чтобы принять их, хунта решила направить двух посланцев к королю Карлу (20 октября 1520 г.) с письмом, в котором излагались и оправдывались все действия повстанцев, а также содержались статьи, еще раз повторявшие их программу без каких — либо существенных изменений. Посланцы отправились в Германию, но один из них был сразу же схвачен по приказу Карла, а другой так и не решился выехать из Брюсселя. Хунта направила письмо португальскому королю с просьбой о поддержке и в то же время попыталась увезти королеву из Тордесильяса. Это известие вынудило королевские власти поторопиться с принятием совместных решительных действий. Были стянуты войска, и так как в ответ на мирные предложения кардинала повстанцы ответили угрозой атаковать Медину и перевешать находящихся там сторонников короля, то королевским указом от 31 октября уже формально была объявлена война комунерос. Компромиссные предложения Вальядолида (образование делегации из 6 законоведов для переговоров с кардиналом и для достижения соглашения с королем на приемлемых условиях) результатов не дали.
Начало военных действий. В силу создавшихся условий хунта готовилась к войне, стягивая свои военные силы; члены хунты упрекали знать, напуганную антифеодальным характером восстания, за то, что она перекочевала в лагерь короля и обратилась против народа, «будучи сторонницей короля лишь по своим собственным корыстным и честолюбивым интересам, в то время как истинным защитником короля является и будет являться народ». В самом деле, правительственная армия состояла по большей части из кастильских дворян, с их слугами и вассалами, и из кавалеров военных орденов.
17 ноября король начал военные действия против комунерос, и несколько дней спустя (когда провалилась последняя попытка мирного соглашения, предпринятая адмиралом) в окрестностях Медины и Риосеко произошли первые стычки между королевскими войсками и войсками Хирона и епископа Акуньи. Не прибегая к решительному сражению, королевской армии удалось в результате умелого отвлечения сил повстанцев достичь Тордесильяса и после четырехчасового боя захватить этот город. В Тордесильясе были, захвачены 13 депутатов хунты. Остальным удалось бежать. Новым местопребыванием хунты был назначен Вальядолид. Дона Педро Хирона обвинили в измене. Бежав из лагеря повстанцев, он подтвердил тем самым, что это обвинение было обоснованным (очень возможно, что бегство его явилось результатом постоянного нажима со стороны родственников, друзей и римского папы). Одновременно дворянство и города Галисии, не затронутые движением комунерос, создали конфедерацию для защиты дела короля и для противодействия развитию этого движения в любой форме. Аналогичную конфедерацию создали андалусские города.
Бесспорно, потеря Тордесильяса и местечка Вильягарсиа (около Медины)» была для комунерос, как писал Варгас королю, не больше чем «некоторой потерей престижа, а отнюдь не серьезным ударом». Вместо ожидаемого уныния население «приходило в еще большее возбуждение», в то время как королевские войска испытывали огромные затруднения в средствах. Именно поэтому Варгас просил короля, во-первых, прислать средства и, во-вторых, вернуться в страну.
3 апреля адмирал сообщил королю, что если тот, как было условлено, не вернется в Испанию до сентября, то все будет потеряно. Повстанцы вновь назначили Падильо командующим войсками и созвали кортесы в Вальядолиде (намерение созвать кортесы было высказано еще в Тордесильясе). В них приняли участие 10 городов и местностей. Кортесами был принят ряд решений. Одновременно с кортесами работала и хунта, действовавшая в качестве как законодательного, так и исполнительного органа. Армия восставших городов, как и королевская армия, также испытывала недостаток в деньгах.
Так, с переменными успехами, прошел январь 1521 г., в целом более благоприятный для повстанцев, армия которых сильно увеличилась за это время. Шансы на успех кампании для сторонников короля значительно снижались из-за споров между правителями о плане дальнейших действий. 23 февраля повстанцы овладели Торрелебатоном (около Тордесильяса), что произвело сильное впечатление, но вместе с тем моментально объединило королевских правителей, принявших решение соединенными силами атаковать Падильо и Акуньо. Лашо, недовольный назначением Падильи, перешел, на сторону короля.
