В результате успешных действий военной контрразведки и пограничников, в тесном взаимодействии с командованием и политорганами фронтов и армий, при активной поддержке местного населения были сорваны все преступные действия врага. Только в 1941 году было обезврежено 4 тыс. шпионов, диверсантов и террористов, из которых свыше 1,5 тыс. в полосе наступления фашистской группы армий “Центр”, наступавшей на Москву. Такая же участь постигла и все другие операции абвера в ходе оборонительных и наступательных действий Красной Армии, в результате чего было задержано и обезврежено около 40 тыс. подготовленных для проведения террористических и диверсионных акций головорезов. Кроме того, территориальные органы госбезопасности выявили и задержали более 2 тыс. агентов-парашютистов.
Осенью 1942 года и в начале 1943 года были предотвращены тщательно подготовленные “Цеппелином” крупномасштабные операции “Шамиль” и “Волжский вал”, целью которых был захват нефтепромыслов Баку и Грозного, вывод из строя железнодорожных мостов через Волгу и другие водные преграды. В ходе этих операций противник забросил в наш тыл свыше 50 диверсионных групп, значительная часть из которых была ликвидирована раньше, чем она приступила к выполнению своих заданий. Другие явились в органы госбезопасности с повинной.
Готовились покушения и на советских руководителей. В 1942 году террорист несколько дней осуществлял наблюдение на Красной площади за работой сотрудников службы безопасности при проездах из Кремля на улицу Куйбышева автомашин с руководителями партии и правительства. Он примелькался службе охраны, и его стали принимать за своего сотрудника.
6 ноября, когда из Кремля вышла машина с А.И.Микояном, этот параноик вскочил вовнутрь Лобного места и открыл оттуда огонь по автомашине. Водитель быстро свернул машину влево и на большой скорости ушел к Историческому музею. В борьбу с террористом вступили чекисты: лейтенанты Л.А.Степин и Вагин, капитан Цыба. В схватке был тяжело ранен лейтенант Степин (впоследствии генерал-майор, скончался 11 сентября 1989 года), но он успел метнуть гранату во внутрь Лобного места. Туда бросились Цыба и Вагин и обезвредили террориста. За этот подвиг лейтенант госбезопасности Л.А.Степин был награжден орденом Красного Знамени, лейтенант Вагин и капитан Цыба — орденом Красной Звезды.
Осенью 1943 года была пресечена операция “Цеппелина” против “Большой тройки” — глав правительств СССР, США и Англии во время проведения Тегеранской конференции. Добытые советской разведкой данные позволили тогда службам безопасности высоких руководителей принять надлежащие меры, с тем чтобы конференция в Тегеране прошла в нормальных условиях, а руководители великих держав находились в полной безопасности.
В сентябре 1944 года под Москвой сотрудники госбезопасности захватили опасных террористов, специально подготовленных с санкции Гитлера и Гиммлера — некоего Таврина, имевшего поддельные документы Героя Советского Союза, и его “жену” — радистку, которые должны были 6 ноября проникнуть в Большой театр на торжественное собрание, посвященное 27-й годовщине Великого Октября, и совершить покушение на советских руководителей, и в частности на И.В.Сталина.
28 февраля 1944 года при проезде через лесной массив в окрестностях г. Ровно был смертельно ранен бандеровскими бандитами и вскоре скончался командующий 1-м Украинским фронтом генерал армии Н.Ф.Ватутин.
В связи со многими сигналами и информацией о покушениях на советских высоких руководителей и крупных военачальников, вынашиваемых диверсионно-террористическими центрами абвера, в годы войны были приняты серьезные меры по обеспечению безопасности и охраны членов и кандидатов в члены Политбюро, секретарей ЦК ВКП(б), высшего командования Красной Армии, командующих фронтами, видных советских ученых, а также Генерального штаба Вооруженных Сил, Академии наук и других важных учреждений. Эту службу несли опытные и верные своему долгу чекисты, которых отличала наивысшая степень преданности Коммунистической партии и Советскому правительству, социалистической Родине.
Немеркнущие подвиги в годы войны совершали чекисты в глубоком тылу врага. За линию фронта забрасывались хорошо подготовленные оперативные группы и разведчики, которые в тяжелых условиях фашистского оккупационного режима вели напряженную борьбу со специальными и карательными органами противника. Вместе с тем они добывали и передавали в Центр информацию о гитлеровских войсках и их намерениях, выводили из строя узлы и линии связи, нарушали работу железнодорожного транспорта, военных и промышленных объектов. Они проникали в разведывательные органы и диверсионные школы и наносили им серьезный ущерб, помогали командованию партизанских отрядов и соединений в ограждении их от нацистских агентов, в проведении ими боевых операций.
Бывший директор ЦРУ Аллен Даллес после войны писал: “Информация, которую добывали советские разведчики во время второй мировой войны ... представляла собой такого рода материал, который являлся предметом мечтаний для разведки любой страны”.