В 2002 году была проведена поисково–спасательная работа в 9-ти субъектах Южного федерального округа вследствие катастрофического наводнения. Специалисты МЧС, других министерств и ведомств спасли в общей сложности 62 тыс. человек, ещё свыше 106 тыс. жителей ЮФО были эвакуированы из опасных зон. Наиболее сложная ситуация сложилась в Минеральных Водах, где уровень воды в реке поднялся выше критической отметки на 5–6 метров, а также в станице Барсуковской Ставропольского края. Сюда в оперативном порядке были направлены две группы спасателей из Москвы, необходимые плавсредства, в том числе плавающий транспортёр «Синяя птица», и вертолёты МЧС. Также в этом же году спасатели МЧС приняли участие в ликвидации теракта на Дубровке в Москве – в операции приняли участие 90 специалистов, совместными действиями более 600 человек было эвакуировано в лечебные учреждения Столицы.
В сентябре 2003 года прошла ликвидация последствий землетрясения в Республике Алтай. 1 октября оперативная группа МЧС России, в состав которой вошли спасатели, кинологи, инженеры связи, медики и специалисты отряда «Центроспас», психологи Центра экстренной психологической помощи МЧС России, вылетела в Барнаул. Авиацией МЧС в республику доставлены полевые кухни, печи, одеяла, продовольствие и медикаменты. Самой основной задачей для спасателей было недопущения случаев травмирования жителей края и за время операции серьёзных случаев не произошло.
23 октября 2003 года на шахте «Западная-Капитальная» произошёл прорыв грунтовых вод, в результате в шахте отключились электроснабжение и связь. На момент аварии в шахте находился 71 человек – 25 спасено сразу. Благодаря кропотливой работе сотрудников МЧС России 25 октября были подняты на поверхность и размещены в больнице 33 шахтёра и 1 горноспасатель.
2004 год – ликвидация последствий взрыва в Московском метрополитене. Около 1300 пассажиров было эвакуировано, в том числе 123 раненых. В марте – ликвидация последствий взрыва газа в жилом доме Астрахани: спасатели в результате расчистки завалов спасли 14 граждан. В 2004 году МЧС также проводило операцию по эвакуации граждан России и стран СНГ из охваченного войной Ирака – в ходе первого этапа вывезли и спасли 487 человек, вторым этапом – 187. В том же году спасатели приняли участие в ликвидации последствия теракта в школе города Беслан: в общей сложности медики МЧС оказали медицинскую помощь 556 пострадавшим, самолётами МЧС России и Минобороны были эвакуированы в лечебные учреждения Москвы 123 человека и в том числе 79 детей.
9 февраля 2005 года произошёл взрыв на шахте «Есаульская» в Кемеровской области – на шахту прибыло 21 отделение горноспасателей, всего в операции по поиску остающихся под землёй людей непосредственно участвовали более 150 человек. А 17 марта 2005 года самолёт Ан-24 потерпел крушение при посадке в аэропорту Варандей Ненецкого автономного округа – спасателями на месте падения самолёта были эвакуированы 18 пассажиров и 5 членов экипажа.
2006 год – ликвидация последствий обрушения купола Басманного рынка в г. Москве – в результате поисково-спасательной операции, к которой привлекались спасатели и пожарные МЧС России, были спасены жизни 33 человек. В апреле – ликвидация последствий разрушительного землетрясения в Корякском АО – силами МЧС России из пострадавших населённых пунктов КАО были эвакуированы в г. Петропавловск-Камчатский 1201 человек, в том числе 601 ребёнок и 11 тяжелобольных. Психологи МЧС России сопровождали в проведении эвакуации и оказывали людям всю необходимую помощь и поддержку. Для пострадавшего от стихии населения Корякского АО в общей сложности было доставлено 317,2 т. гуманитарных грузов, в том числе с применением авиации МЧС. В том же году в ночь на 9 декабря произошёл пожар в наркологической больнице № 17 г. Москвы: прибывшие на место спасатели с помощью специального инструмента срезали решётки и вывели из корпуса 160 человек, 10 из них были госпитализированы. В сентябре началась ликвидация пожара в шахте «Центральная» Вершино-Дарасунского рудника в Читинской области – спасателями спасено 39 человек.
В 2006 году прошла операция по эвакуации российских граждан и граждан стран СНГ из охваченной войной Ливана. На первом этапе, с 19 по 22 июля, 11 спецрейсами МЧС России в г. Москву были доставлены более 1400 человек – граждане России, стран СНГ и прибалтийских государств. 25 июля двумя самолётами МЧС из Латакии в Москву были доставлены 216 человек, ещё 120 человек были эвакуированы с Кипра. В ходе двух этапов эвакуации самолётами МЧС России были доставлены в г. Москву в общей сложности 1701 человек, в том числе 555 детей.
