Все произошедшие теракты стали тяжёлыми для всей правоохранительной системы, которую в корне следовало менять для недопущения подобных случаев в будущем. Именно с событий в Беслане изменения стали для всей России решением № 1 в обеспечении безопасности российских граждан и уничтожении главного врага российского государства – терроризма. Самим боевикам не удалось уничтожить систему правопорядка страны, а наоборот сделали противоположное явление во вред себе, так как правоохранительные органы России учли все недостатки и неудачи, проанализировав всё это и усилив силовые ведомства для полной ликвидации терроризма на территории Российской Федерации. Конкретно после теракта в Беслане в органах МВД регионов Осетии и Ингушетии начались судебные процессы над самими правоохранительными сотрудниками, что проявили в себе халатность, а также за пренебрежительное отношение к своим полномочиям и званию, что было позволено при исполнении должностной службы и повлекшее к непредвиденным обстоятельствам. Так были заведены дела по милиционерам Правобережного и Малгобекского РОВД. Был схвачен и проведён судебный процесс над единственно выжившим боевиком – участником теракта Беслана, Нурпашей Кулаевым, который получил пожизненный срок в тюрьме. Дальнейшим действием стало подписание в 2006 году Владимиром Путиным указа № 116 «О мерах по противодействию терроризму», согласно которому был образован Национальный антитеррористический комитет (НАК), основными задачами которого стали разработка мер по противодействию терроризму, координация деятельности федеральных органов исполнительной власти, а также организация их взаимодействия с органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации, органами местного самоуправления и общественными организациями.
Для всех правоохранителей России период 2000–2010 годов стал «войной с терроризмом», с чередой последующих терактов и ликвидацией самих террористов. 19–22 июня 2001 года в станице Ермоловская Чеченской республики объединёнными силами «Альфы», бойцов ЦСН, разведчиками 6 бригады войск МВД и подразделениями Министерства обороны ликвидировали бандформирование одного из самых свирепых боевиков – Арби Бараева (Эмир Тарзан), отличившийся убийствами и похищениями людей для работорговли. 11 июля 2001 года в Чечне будет ликвидирован террорист – подрывник Абу Умар, виновник взрывов жилых домов в Москве и в Волгодонске в сентябре 1999 года. 8 апреля 2004 года будет ликвидирован Абубарак Васимбаев – вербовщик женщин в ряды террористок–смертниц и один из участников проведения теракта на Дубровке. 26 ноября 2006 года будет ликвидирован представитель «Аль–Кайды» (террористическая организация, запрещённая в РФ) и главарь всех иностранных боевиков на Северном Кавказе – боевик Абу Хафс. 28 апреля 2002 года происходит взрыв бомбы на центральном рынке во Владикавказе – десять человек погибли, 40 ранены – исполнители теракта Руслан Чахкиев и Мовсар Темирбиев, были задержаны и в июле 2002 года и осуждены (Чахкиев приговорен к 24 годам лишения свободы, Темирбиев – к 18 годам). 9 мая 2002 года в центре Каспийска (Дагестан) во время торжеств, посвящённых Дню Победы, взорвана бомба – погибли 43 человека, в том числе 12 детей: спонсором преступления, по версии следствия, выступал подданный Королевства Саудовская Аравия Абу Аль‑Валид Аль‑Хамиди, уничтоженный потом в ходе операции федеральных сил в 2004 году. В июне 2003 года был ликвидирован организатор многих преступлений в Чечне и в России – Хож‑Ахмед Душаев, уничтожен в ходе спецоперации в селе Экажево Ингушетии. 10 июля 2003 года в ресторане на 1‑й Тверской‑Ямской улице в Москве была задержана жительница Чечни Зарема Мужихоева, намеревавшаяся взорвать бомбу, спрятанную в сумке: во время операции по обезвреживанию бомбы погиб взрывотехник – майор ФСБ Георгий Трофимов. В апреле 2004 года террористка Мужихоева осуждена к 20 годам тюрьмы.
