С первых же дней войны действовать в трудных условиях пришлось силам и средствам РЭР КБФ. Развернувшиеся военные действия при высоком темпе наступления противника привели к тому, что силы и средства радио-разведки КБФ понесли тяжелые потери (до 60 % состава подразделений и техники). Не имея возможности эвакуировать стационарные радиопеленгаторы (единственная маневренная радиопеленгаторная станция «АВТО-3» для радиоотряда КБФ была принята его представителем военным техником капитаном 2 ранга П.М. Румянцевым согласно акта 29 мая 1941 года, опечатана печатью отряда и оставлена на хранение в НИМИСТ ВМФ до отправки)[592] и не получив приказа на уничтожение техники, личный состав пеленгаторных пунктов оставался на позициях до конца, мужественно сражаясь с врагом и выполняя поставленные задачи. В первые дни войны из пяти береговых радиопеленгаторных пунктов (БРП) КБФ два (Лиепая и Белосток) были утрачены уже 23 июня, так как попали в окружение вместе с нашими войсками. Погибло 28 человек. В отряд прибыло 4 человека из Лиепаи и 14 человек из Белостока[593].
1 июля 1941 года в связи с быстрым продвижением немецких войск в Прибалтике командованием КБФ было принято решение о передислокации берегового радиоотряда (БРО) и радиопеленгаторного пункта Палдиски на старое место базирования – г. Ораниенбаум. Решением Военного совета КБФ для передислокации отряда и пункта было выделено дополнительно к имеющимся в отряде девяти автомобилям еще десять, а также морской транспорт. Весь личный состав и техника были разделены на два эшелона. Основная часть разместилась на 19 автомобилях, а второй эшелон был погружен на дизель-электроход «Иосиф Сталин» и транспорт «Майя». 3 июля началось движение. Автоколонну возглавил старший лейтенант А.И. Ермолаев, а второй эшелон – капитан Б.С. Мерцалов. Оба эшелона прибыли в район Ораниенбаума, где с помощью 7-го отдела НИМИСТ под руководством А.В. Стороженко в короткий срок смонтировали аппаратуру и антенное поле. Часть имущества, доставлявшегося на транспорте «Майя», погибла вместе с судном. 5 июля, через двое суток после передислокации отряда, боевые посты приемного центра начали функционировать[594]. В период передислокации отряда радиоразведка осуществлялась оперативной группой под командованием старшего лейтенанта В.М. Адамова, оставленной при разведке штаба флота в Таллине.
Во время перемещения отряда из Таллина в Ораниенбаум, сразу же по прибытии, 3 июля, на БРП в Гакково была направлена оперативная группа в составе: начальник оперативного отделения – Мерцалов, командир по оперативной части – капитан В.И. Никушин и шесть радистов приемного центра (ПЦ). Эта группа организовала обработку PPM всех постов слежения и действующих радиопеленгаторных пунктов. С развертыванием в Ораниенбауме прибывшей из Таллина аппаратуры, группа 5 июля была возвращена в БРО[595].
6 июля, в связи с приближением линии фронта и частыми бомбардировками, БРП в Невеле был передислоцирован в район Луги, затем в район Ржева, а позднее в отряд (Ораниенбаум). 3 августа был сформирован еще один радиопеленгаторный пункт штатом в 15 человек, отправленный на о. Эзель (о. Сааремаа) для взаимодействия с таллинской группой. Последняя докладывала в штаб флота разведывательные сведения, добытые и эзельской группой. Кроме того, через таллиннскую группу докладывались командованию и некоторые данные, добытые отрядом в Ораниенбауме[596].
Потеря и передислокация береговых радиопеленгаторных пунктов ухудшили гониобазу отряда. Поэтому 11 июля 1941 года был создан и направлен в район Луги передвижной радиопеленгаторный пункт на трех автомашинах. Одновременно, по заданию Главного морского штаба ВМФ, для подготовки запасной позиции отряда (приемный центр второй линии) в районе Боровичи-Старая Русса-Осташково во главе с Румянцевым было отправлено 23 человека с аппаратурой, освободившейся от закрытия боевых постов, осуществлявших разведку в радиосетях Великобритании и Швеции, а также всей резервной аппаратурой и монтажным материалом[597]. Однако, ввиду неудовлетворительных условий для ведения РЭР, 11 августа личный состав из района Боровичи был отозван в отряд.