Когда в 2017 году церковь потребовала себе более 20 зданий музея-заповедника «Херсонес Таврический» в Крыму, Патриарх не высказывался на эту тему, хотя во время аналогичных споров в России: о передаче Исаакиевского собора в Петербурге и Музея Рублева в Москве – он делал заявления и даже сам письменно обращался в Росимущество. После назначения директором музея-заповедника в Херсонесе священника (автор не считает этот факт положительным), патриарший совет по культуре дистанцировался от этого решения: заявил, что Патриарх Кирилл об этом не знал и не благословлял.
Ежегодно после присоединения Крыма в июле на полуострове проводятся торжественные мероприятия, связанные с крещением Руси: Русская православная церковь подчеркивает, что первый православный князь, Владимир, крестился именно в Херсонесе. Ни разу на молебны и крестные ходы в Крыму в эти дни Патриарх не приезжал: в 2014 году он служил литургию в Храме Христа Спасителя в Москве, в 2015-м выступал в Кремле (тогда отмечалось 1000-летие со дня смерти князя Владимира), в 2016-м совершил визит в Орловскую митрополию, в 2017 году провел службу в Санкт-Петербурге, в 2018 и 2019 годах возглавлял крестный ход к недавно установленному в центре Москвы памятнику упомянутому князю.
С присоединением Крыма Патриарх Кирилл попал в достаточно сложную ситуацию. Ведь признание этого факта означало бы, что церковные границы привязываются к государственным. Но признай Патриарх Кирилл, что границы государства и церкви – это одно и то же, РПЦ могла бы лишиться значительной части своих приходов на Украине. Согласно государственной статистики Украины, это около 12 тысяч юридических лиц по всей территории страны. Для сравнения: в самой России 17 тысяч приходов. Всего в РПЦ 35 тысяч общин (помимо России и Украины, это Беларусь, Молдова, страны СНГ, страны Европейского Союза и Юго-Восточная Азия). Получается, на Украину приходится около 40 % церковной инфраструктуры – высокая цена за Крым. (Д.Горевой. 25.09.2019 г. https://www.currenttime.tv/a/patriarch-and-crimea/30181753.htm). Святые и духовные принципы принесены в жертву конъюнктурным.
Материальная база РПЦ начала развиваться с передачи церкви объектов религиозного назначения из госфондов. С 1995-го по 2010 г.г. религиозным организациям по всей России было передано около 1,1 тыс. культовых зданий. По закону 2010 года наметили за год передать церкви 10.643 объекта религиозного назначения (Т.В.Растимешина. «Возвращение церкви объектов культурного наследия в контексте внутриполитических тенденций в России // Экономические и социально-гуманитарные исследования. 2014, № 1 (1), с.143).
Это вызвало неоднозначную реакцию в обществе. Так, 19.02.2010 г. было распространено письмо ряда сотрудников ведущих российских музеев Президенту РФ Д.А.Медведеву, в котором они призывали не передавать РПЦ религиозные памятники из музейных фондов, мотивируя свою позицию тем, что «передача древних храмов с фресками и иконами, а также икон и драгоценной богослужебной утвари из фондов музеев в церковное пользование выведет их из контекста культурной жизни общества и может привести к их гибели» (Сотрудники ведущих музеев РФ обратились к Медведеву с призывом не передавать РПЦ религиозные памятники из музейных фондов. NEWSru.com, 19.2.2010). 3.03.2010 г. работники искусства и науки опубликовали Открытое письмо Патриарху Кириллу (Открытое письмо работников искусства и науки Святейшему Патриарху Московскому и всея Руси Кириллу//Независимая газета. 3.03.2010), в котором говорилось о возможных негативных последствиях передачи памятников истории и культуры, признанных общенациональным и мировым достоянием: «Лишение древних памятников их музейного статуса будет означать отказ от признания церковного и шире – религиозного искусства неотъемлемой частью великой культуры России и в итоге приведёт к разделению народа исключительно по конфессиональному принципу». 25.02.2010 г. директор музеев Московского Кремля Е.Ю.Гагарина заявила, что законопроект о передаче Церкви музейных ценностей может привести к их утрате (Директор музеев Московского Кремля опасается, что передача Церкви музейных ценностей приведет к их утрате. NEWSru.com, 25.2.2010). И т. п.