Дети обучались высшему классу верховой езды, прыгали в высоту через колючий кустарник или лезвия мечей, выполняли сложнейшие акробатические и гимнастические упражнения на высоко подвешенном тонком бревне или на веревке. Для того, чтобы передвигаться по территории противника, мало было уметь хорошо бегать – нужно было учиться ходьбе.
Одна из загадок ниндзя – хождение по потолку. Секрет заключался в специфике устройства потолков японских комнат, украшавшихся открытыми рельефными балконами и стропилами, проходящими на небольшом расстоянии друг от друга. Ниндзя, упираясь руками и ногами в параллельные балки или же цепляясь при помощи "кошек", повиснув спиною к полу, могли перебраться через всю комнату, не касаясь пола.
В зависимости от сложившейся ситуации, ниндзя мог воспользоваться одним из следующих способов ходьбы:
"крадущийся шаг” – мягкое, бесшумное перекатывание с пятки на носок;
"скользящий шаг" – обычный способ дугообразного движения стопы, применяемый в КЭМПО;
"уплотненный шаг" – перемещение по прямой, плотно прижимая носок задней ноги к пятке передней ноги;
"прыжковый шаг" – по технике, напоминающий "тройной прыжок";
"ходьба боком” – перемещение "приставным шагом" или спиной, чтобы помешать погоне определить направление движения;
"односторонний шаг" – прыжки на одной ноге;
"врезка лунок" – ходьба на носках или на пятках;
"малый шаг" – по принципу "спортивной ходьбы";
"ходьба вразбивку" – зигзагообразные движения;
"большой шаг” – нормальный широкий шаг.
При групповых операциях на местности, ниндзя двигались "след в след", часто использовались для ходьбы высокие легкие ходули из бамбука – такуэума. Детей заставляли в любую погоду ходить нагишом, подолгу обходиться без пищи и воды, по нескольку дней находиться в кромешной темноте, набиванием, натиранием и диетой добивались сверх-естественной подвижности суставов и нечувствительности к боли, превращая кожу тела в своеобразную "железную рубашку". В результате ниндзя мог сутками сохранять неподвижность и находиться в воде, подолгу задерживая дыхание; мог прыгать с высоты до 10 метров, взбегать на отвесные скалы, легко перепрыгивать заборы, ловить рукой выпущенную в упор стрелу, прекрасно видеть в темноте, вынимать из суставной сумки руку или ногу, удлинять на несколько сантиметров руку и увеличивать свой рост. К тому же они обладали прекрасной зрительной памятью, имели отличный слух, по свисту стрелы могли определить расстояние до лучника, по лязгу оружия – его вид. Они различали голоса птиц и зверей, искусно им подражали, умели готовить яды и лекарства, взрывчатые вещества, владели навыками акупунктуры и хирургии.
Зрительная память развивалась специальными упражнениями на внимательность. Например, на камне раскладывались предметы, накрытые платком, которые ниндзя, увидев на несколько секунд, должен был без запинки перечислить. Постепенно увеличивая число предметов и уменьшая время на их демонстрацию, ниндзя мог по памяти восстановить во всех деталях сложную техническую карту и дословно воспроизвести дюжину страниц однажды прочитанного текста.
Слух доводился до такой степени изощренности, что ниндзя не только различал по голосу всех птиц и угадывал в птичьем хоре условный сигнал партнера, но и "понимал язык" насекомых и пресмыкающихся. Так, умолкнувший хор лягушек на болоте говорил о приближении врага, а громкое жужжание комаров под потолком свидетельствовало о засаде на чердаке. Приложив ухо к земле, по топоту копыт могли определить количество лошадей в коннице. По звуку камня, брошенного со стены, можно было определить глубину пропасти и уровень воды с точностью до метра. По дыханию спящих за ширмой могли точно определить их пол, возраст и количество. Многолетние упражнения слуха, осязания и обаяния помогали ниндзя вслепую судить о близости огня по степени теплоты, о соседстве человека— по звуку и запаху. Мельчайшие перемены потоков воздуха позволяли отличить сквозной проход от тупика и большую комнату от каморки.
Обитатели горных районов с детства приучались лазить по отвесным скалам и каменистым осыпям, спускаться в расселины, переправляться через стремнины и бездонные пропасти, чтобы затем только лишь при помощи рук и ног уметь взобраться на неприступные стены замков и проникать во внутренние покои монастырей. Секрет искусства скалолазания (сака-нобори или тохэки-дзюцу) заключался в умении концентрировать силу и жизненную энергию КИ (ЦИ) в кончиках пальцев, чтобы малейший бугорок или выступ на стене могли стать надежной опорой. Мысленно устремляясь "вглубь" стены, как бы прилипая телом к каменному массиву, ниндзя мог, нащупав два-три выступа, уверенно продолжать путь наверх.