Сторонники автономии (а в этом вопросе практически все слои общества были единодушны) напоминали, что Украина присоединилась к Москве добровольно и вправе рассчитывать на достойное место в политическом устройстве российского государства. Граф Румянцев был поставлен в тяжелые условия, поскольку перед ним была поставлена задача обеспечить выборы депутатов, лояльных центральной власти. (Не правда ли, как знакомо!). Действовал он грубо и решительно: когда в Нежинском полку местная старшина дала наказ свои депутатам добиваться возвращения гетманской власти, Румянцев объявил выборы недействительными и арестовал депутатов. Послушный суд присудил ретивых инакомыслящих к смертной казни, однако, императрица помиловала осужденных, продемонстрировав свой либерализм. Работа депутатов в Комиссии очень напоминает работу первой государственной Думы, а также первого Съезда народных депутатов СССР 1989 года. На Комиссии был зачитан Наказ императрицы и начались бесконечные прения представителей, не имеющих навыков политических баталий и отстаивающих разные по направленности и содержанию интересы. Но ни всеобщий настрой, ни пламенные выступления депутатов, ни слезные обращения и петиции не помогли. Российское правительство и сама Екатерина только укреплялась в планах еще более тесного вовлечения Украины в государственную структуру России. Проверенным методом для решения этой задачи оказался метод "кнута и пряника", новым содержанием которого стало с одной стороны введение крепостного права в Украине, а с другой - предоставление малороссийской старшине дворянских прав.
Еще во время своего правления гетман Разумовский издал специальный универсал, запрещавший посполитым переходить из одного поместья в другое с нажитым имуществом. Одновременно под страхом угрозы уплаты штрафа другим хозяевам запрещалось принимать селян. Екатерина II продолжила этот курс в отношении закрепления крестьян: в 1763 году крестьяне могли покидать своих хозяев при условии получения от них отпускных свидетельств, а в 1772 году по ее указанию Малороссийская коллегия вообще запретила всякие переходы, после чего для поимки и возврата беглецов устанавливались заставы на дорогах. Еще некоторое время издавались указы и распоряжения, направленные на возврат крестьян к своему владельцу. Но в апреле 1783 года Екатерина издала новый указ, по которому законодательно закреплялось социальное и территориальное положение всего украинского населения на основании проведенной ревизии душ. Более миллиона крестьян оказались в частном владении, что сравняло их социальный статус со статусом большинства населения в российских губерниях. Работа Комиссии по созданию Уложений, в бесперспективности которой Екатерина убедилась довольно быстро, была прекращена начавшейся в 1768 году русско-турецкой войной. В этой войне участвовало и Войско Запорожское.
На время русско-турецкой кампании Румянцевские реформы были приостановлены, сам генерал-губернатор был назначен главнокомандующим российских войск. Война, в которой участвовали городовые и запорожские казаки, оказалась удачной для российской короны. Войска разбили турок, заняли Крым и Молдавию и закрепилась на части черноморского побережья. Русско-турецкая война закончилась Кучук-Кайнарджийским миром, по которому турки лишились протектората над Крымским ханством, а российские войска вместе с запорожцами заняли Крым, который через несколько лет (в 1783 году) был включен в состав Российской империи. Свершилось! Многовековое соперничество нашло свое разрешение, российская империя достигла теплых морей, южные рубежи России стали, наконец, безопасными.
Вернувшись в Украину, Румянцев продолжил реформаторскую деятельность. В 1781 году территория Гетманщины была поделена на три губернии:Киевскую, Черниговскую и Новгород-Северскую, которые образовали Малороссийское генерал-губернаторство. Глухов перестал быть столицей, а в губернских городах были образованы административные и судебные учреждения, наподобие общероссийских.