Бои, начавшиеся с февраля, не принесли успеха французам. Несмотря на недостаток вооружения, Лю Минчжуань сумел организовать оборону и на юго-восточном побережье острова. К марту на севере скопилось не менее 30 000 китайских солдат. Строились земляные сооружения, возводились мосты и переходы через реки. Регулярным войскам помогали ополченцы. Кампания на Тайване грозила стать бесконечной. И это отягощалось еще и тем, что французские войска не отличались боеспособностью, а тяжелые климатические условия и эпидемии еще более понижали ее.
Чтобы облегчить положение своих сухопутных войск на Тайване, китайский флот в начале 1885 года провел свой первый и последний в этой войне боевой поход. В январе из Шанхая отправилась на юг эскадра адмирала У Анькана, состоявшая из четырех больших крейсеров и посыльного судна. В походе также должны были участвовать два крейсера северной Бэйянской эскадры, но Ли Хунчжан, фактически руководивший внешней политикой Китая, отослал их в Корею, где назревал конфликт с Японией.
К началу февраля эскадра У Анькана дошла до Тайваньского пролива и, ограничившись там демонстрацией, повернула обратно. Между тем адмирал Курбе, получив сведения о выходе в море китайского флота, с тремя большими крейсерами отправился к Шанхаю, а потом двинулся навстречу противнику.
Встреча китайской и французской эскадр произошла 13 февраля 1885 года у острова Чусан у побережья провинции Чжэцзян. Не принимая боя, У Анькан с тремя новыми крейсерами оторвался от французов и ушел в Чжэньхай – портовый пригород Нинбо. Старый тихоходный крейсер и посыльное судно укрылись в ближайшей гавани Шипу, где следующей ночью французы подорвали их минами. А в это время во Франции колониальные авантюры правительства Жюля Ферри слишком дорого обходились французскому народу, и 20 марта произошло падение кабинета. Адмиралу Курбе следовало торопиться, чтобы закончить войну с результатами, приемлемыми для престижа Франции.
Еще 11 февраля 1885 года министр флота телеграфировал Курбе секретную инструкцию, что правительство решило в апреле эвакуировать войска из Цзилуна. Министр предписывал: «С настоящего времени действуйте с войсками, находящимися в вашем распоряжении, так, как найдете возможным». И еще: «Необходимо в интересах переговоров, чтобы наше решение эвакуировать Формозу сохранялось в строжайшем секрете». Ответ Амадея-Анатоля Курбе последовал такой: «Все будет зависеть от возможных операций с наличным контингентом войск. Считайте, что секрет будет сохранен. Поступлю с войсками, как вы указываете».
В марте 1885 года французские десантные силы начали наступление на севере Тайваня, заняв угольные шахты Цзилуна. Тогда же адмирал Курбе провел десантную операцию по захвату Пескадорских островов в Тайваньском проливе. Китайские укрепления на острове Магун были взяты штурмом. Курбе начал укреплять Магун в качестве главной базы своего флота.
1 апреля 1885 года французский флаг взвился над островами, объявленными французским владением. Но уже 4 апреля Франция и Китай подписали предварительное соглашение о перемирии. Французский флот вынужден был снять блокаду торговых портов Китая, но продолжал блокировать китайскую военную эскадру в Чжэньхае. Французские десантные войска оставались на Тайване и Пескадорских островах, в то время как китайские начали уходить из Северного Вьетнама.
9 июня 1885 года в Тяньцзине был подписан окончательный франко-китайский мирный договор. По нему Китай признавал, что весь Вьетнам контролируется Францией, и с вьетнамской территории выводились все китайские войска. Со своей стороны, Франция выводила свои войска и флот с Тайваня и Пескадорских островов и отказывалась от требований контрибуции.
21 июня остатки французского отряда, занимавшего Тайвань, покинули остров. А за десять дней до этого на Пескадорах умер адмирал Курбе, и это избавило его от бесславного возвращения во Францию.
Франко-китайская война сопровождалась сложной дипломатической игрой; впервые в этой игре стал козырем Тайвань, а Японии предлагалась роль равноправного партнера. Внимание Японии к Тайваню как к объекту предстоящей агрессии не исчезало. Но операции французов еще раз показали трудность военных действий на этом острове. Становилось ясно, что это твердый орешек.
После Японо-китайской войны 1894–1895 годов, по условиям Симоносекского мирного договора, Тайвань перешел под управление японской администрации.