Скафтымов, помимо фольклора, исследовал творчества Николая Гоголя, Федора Достоевского, Льва Толстого, Михаила Лермонтова, Александра Островского, Антона Чехова. Литературовед Н.Я. Берковский в 1959 году писал Скафтымову: «Вы издавна занимаете в нашей науке о литературе совершенно собственное, свое, независимое место. Работы Ваши – талантливый, тонкий перевод с особого языка искусства на обще-язык, философский и идеологический. <…> Все внимание Вы уделяете иррациональному в тексте, тому, обо что ты запинаешься, читая текст, и именно из иррационального Вы и выводите рациональное, «идейное». К.И. Чуковский в том же году в письме к Скафтымову высоко оценивал его творчество: «Когда читаешь Вашу книгу, кажется, что поднимаешься на крутую гору – и с каждым шагом перед тобой развертывается новое, чего не видел за секунду до этого. Но восходить на крутые горы трудно, и потому Ваша книга трудна для людей, не привыкших думать. <…> Книга Ваша значительно больше своего объема, оттого-то она, вот увидите, – будет поразительно живуча, окажется необычайно прочна». А литературовед Л.Я. Гинзбург в рецензии на скафтымовскую книгу «Статьи о русской литературе» отмечала: «Сила работ А. Скафтымова в том, что он не декларирует свои убеждения, но добывает их тонким анализом текста <…> Проблемы, разработанные в этой книге, – единство содержания и формы, специфика метода великих русских реалистов, природа драматического конфликта, этика и психологизм – в высшей степени актуальны и современны. «Статьи о русской литературе» А. Скафтымова – плод многолетнего труда подлинно творческого и проникнутого сознанием высокой ответственности ученого. Очень жаль, что эта книга издана крайне незначительным тиражом; практически за пределами Саратова она почти не получила распространения». Скафтымов был убежден: «Сколько бы мы ни говорили о творчестве читателя в восприятии художественного произведения, мы все же знаем, что читательское творчество вторично, оно в своем направлении и гранях обусловлено объектом восприятия. Читателя все же ведет автор, и он требует послушания в следовании его творческим путем. И хорошим читателем является тот, кто умеет найти в себе широту понимания и отдать себя автору». Скафтымов является автором книг «Поэтика и генезис былин: очерки» (1924), «Жизнь и деятельность Н.Г. Чернышевского» (1939, 1947), «Статьи о русской литературе» (1958), «Нравственные искания русских писателей: статьи и исследования о русских классиках» (1972), «Поэтика художественного произведения» (2007), «Собрание сочинений» в 3 томах (2008) и др.