В тяжелые дни блокады города Ленинграда, будучи начальником штаба Осиновецкой военно-морской базы организовывал «Дорогу жизни» и принимал непосредственное участие в перевозках людей, боезапаса и продовольствия, выполняя обязанности морского коменданта порта Осиновец, показав образцы смелости, отваги и работоспособности, под сильным воздействием противника с воздуха.
В 1942 году в результате истощения и болезни был эвакуирован из Ленинграда в Челябинскую область, город Шадринск.
На Волге
После восстановления был направлен на должность начальника штаба 3-й бригады речных кораблей Волжской военной флотилии, а позднее стал ее командиром.
В октябре-ноябре 1942 года с Северной группой бронекатеров и отрядом вооруженных катеров типа «Я-5» участвовал в защите города Сталинграда. Вел огневое содействие и совместные действия с частями Красной Армии на стыке Сталинградского и Донского фронтов в районе Томилино (99-й и 300-й стрелковых дивизий).
Весной 1942 года под командованием Кириллова Н.К. осуществлен сложнейший переход шести подводных лодок и трех плавучих доков из Астрахани в Горький.
На море Азовском
В предвидении скорого выхода войск Красной Армии на Азовское побережье Народный комиссар Военно-Морского Флота Н. Г. Кузнецов еще 3 февраля 1943 г. подписал приказ, в котором обязал Военный совет Черноморского флота сформировать Азовскую военную флотилию.
Одной из главных задач для Азовской военной флотилии были высадки тактических десантов на побережье Азовского моря, занятого противником.
Лучшей кандидатуры на должность начальника отдела боевой подготовки Азовской военной флотилии, которому и предстояло осуществлять десантные операции, чем Николай Константинович Кириллов не было. «Офицер бывалый: еще в гражданскую командовал ротой. Потом учился, стал моряком, вырос до командира дивизиона кораблей. Окончил Военно-морскую академию. Преподавал на курсах командного состава. С начала Великой Отечественной воевал на Балтике, потом – на Ладоге. На Волжской военной флотилии командовал бригадой кораблей. Словом, человек боевой, умеющий работать с людьми. Он налаживал порядок в учебе и экипажей, и командиров, на деле показывал офицерам, как строить бой и добиваться победы. Командующий доверял ему самые сложные задачи» – так писал о нем в своей книге «Воплощение замысла» начальник штаба Азовской военной флотилии Аркадий Владимирович Свердлов.
История малого охотника СКА-0412, которую мы рассматриваем, тесно связана с Кирилловым Н.К. СКА-0412 неоднократно назначался флагманским кораблем во время тактических десантов и Николай Константинович хорошо знал офицеров и экипаж катера.
29-30 августа 1943 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-0412) – командир десантной операции у села Безыменное («Таганрогский десант»).
Капитан 2 ранга Кириллов Н.К., являясь командиром операции по высадке десанта, в ночь с 29 августа на 30 августа 1943 года в районе поселка Безыменовка, в результате тщательно продуманной подготовки и умелым управлением частями и подразделениями успешно выполнил боевую задачу. Несмотря на сложные условия, плохую видимость корабли произвели перестроение, подошли к берегу противника скрытно и бесшумно, высадили первый бросок, который подавил огневые точки противника, не дав ему развернуться для боя – высадил десантный отряд. В результате боя вражеский гарнизон поселка Безыменовка был разгромлен – уничтожено до 200 немцев, два танка, до 200 автомашин, потоплен сторожевой катер противника, захвачено в плен 20 солдат и матросов противника.
7-8 сентября 1943 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-0412) – командир высадки десанта у селения Ялта-Мариуполь («Мариупольский десант»).
9-10 сентября 1943 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-0112) – командир высадки десанта у селения Мелекино («Мариупольский десант»).
16-17 сентября 1943 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-0112) – командир высадки десанта у селения Лиски-Луначарское западнее города Осипенко («Десант у Осипенко»).
24-25 сентября 1943 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-0412) – командир высадки десанта в районе Голубицкое-Темрюк («Темрюкский десант»).
2-3 ноября 1943 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-0112) – командир высадки десанта у села Опасная-Рыбпром («Керченско-Эльтигенская десантная операция»).
9-10 января 1944 года Кириллов Н.К. (на борту малого охотника СКА-048) – командир высадки и 2-й десантной группы в 1 км восточнее мыса Тархан («Десант на мыс Тархан»).
10 января 1944 года в 7 часов 37 минут погиб смертью храбрых при высадке десанта в 1 км восточнее мыса Тархан Керченского полуострова, при налете авиации противника от немецкого 20-мм снаряда.