Сын Ярослава, знаменитый Александр Невский, много сделал для Новгорода, но тоже не пользовался любовью простого народа. Следуя примеру своего отца, он всегда стеснял народную волю и держался партии богачей. Признавая над собой власть завоевателя всей Руси, татарского хана, Новгород признал свое единение со всей русской землей. Начиная с Александра Невского, образовался обычай, по которому новгородским князем был тот, кто назывался великим. Но при всем том Новгород, не разоренный татарами, отдохнувший от войны с суздальскими князьями и гордый победами над иноземными врагами, крепче прежнего держался за свои права вольности. Приглашая в 1266 году на княжение брата Александра, Ярослава Тверского, новгородцы предложили ему письменные условия, или договорную грамоту. Грамота эта, сохранившаяся до сего времени, начиналась так: «Благословение от владыки, поклон от посадника Михаила и от тысяцкого Кондрата, и от всего Новгорода, и от всех старейших и от всех меньших к князю Ярославу. На сем, княже, целуй крест ко всему Новгороду, на чем целовали деды и отцы и отец твой Ярослав». Затем идут восемь параграфов, в которых указываются князю его обязанности относительно жителей и излагаются предупреждения против разных насилий и самовольства, которые допускались его предшественниками. Несмотря на крестное целование, Ярослав не раз нарушал условия, и новгородцы ссорились с ним и даже выгоняли его. Помирившись, Ярослав оставался новгородским князем, будучи в то же время и великим. Тогда же вошло в обычай в Новгороде иметь, кроме великого князя, еще князей, которые получали от новгородцев в кормление волости и предводительствовали новгородскими войсками во время войн. От княжения Ярослава в Новгороде сохранился устав о мостовых и договорная грамота с немецкими торговыми городами и Готландом. Сыновья Александра, Дмитрий и Андрей, долгое время ссорились из-за великого княжения. Новгород волей-неволей принимал участие в этих распрях, беря сторону того князя, которому покровительствовал хан. Дмитрий тоже вооружил против себя новгородцев самовластием. Междоусобие партий и кровопролитные мятежи не прекращались во все время его княжения. Наоборот, Андрей старался не нарушать воли народа, потому в продолжение десяти лет его княжения новгородцы жили более спокойно и вели удачную борьбу с внешними врагами.
В это время начинает входить в силу ничтожное до сих пор княжество Московское, первым князем которого был третий сын Александра Невского Даниил. После смерти князя Андрея снова возгорелась борьба из-за великого стола, но уже между князьями тверскими и московскими. И опять Новгород принимал участие в борьбе, склоняясь на сторону более сильных московских князей. Сделавшись великим князем, Михаил Ярославич Тверской прислал в Новгород своих наместников. Новгородцы, привыкшие за последнее время обходиться и совсем без князя, были сильно оскорблены. Они выгнали наместников и двинулись с войском к Торжку, чтобы защищать свои границы со стороны Твери. Михаил встретил их также с войском, но вместо битвы начались переговоры. Были составлены договорные грамоты; хан, со своей стороны, дал грамоту Михаилу на княжение в Новгороде, и новгородцы должны были признать его князем. Но Михаил не выполнял никаких условий, и в Новгороде снова начались беспорядки, сопровождаемые поджогами и грабежами. Михаил поступал так, как поступали когда-то суздальские князья. Он остановил хлебные обозы, захватил Торжок, Бежичи и все окрестные земли. По просьбе архиепископа Михаил заключил мир и взял с новгородцев полторы тысячи гривен серебра. Чтобы освободиться от его притеснений, новгородцы вступили в союз с московским князем Юрием Даниловичем, врагом Михаила. Продолжительная и кровопролитная борьба кончилась со смертью Михаила в орде.