Обладая большим организационным опытом, Дюбуа сделал очень многое для закрепления и развития тех связей между деятелями негритянского движения, которые были установлены на первом и втором конгрессах. С целью всемерного укрепления возникших связей он создал в 1921 году постоянный секретариат, проделавший большую работу в этом направлении Когда после первых успешных конгрессов наступили трудные времена для панафриканизма, никто не сделал так много, как Дюбуа, чтобы поддержать это движение, не дать ему распасться, а после второй мировой войны превратиться в силу, оказавшуюся в состоянии торпедировать колониальную систему на Черном континенте. Как подчеркивал Педмор, Дюбуа «в идеологическом отношении всегда был впереди своих современников». И эта идеологическая подготовленность Дюбуа позволила ему превратить движение, начатое им и небольшой группой энтузиастов, в идею международного масштаба.
В 1923 году состоялся третий конгресс, работа которого проходила в Лондоне, Париже и Лиссабоне. Как по количеству участников, так и по практическим результатам этот конгресс был слабее двух первых.
Утверждения о поражении Дюбуа, о провалах его планов не соответствуют действительности. Надо учесть, какую огромную роль сыграли идеи Дюбуа в развитии национально-освободительного движения в Африке после второй мировой войны. Необходимо принять во внимание и огромные трудности, стоявшие на пути реализации планов Дюбуа. С учетом всего этого можно и нужно рассматривать деятельность Дюбуа в этой области как исключительно успешную.
Что касается трудностей, то они были очень многочисленны и серьезны. Фактически Дюбуа руководил этим движением В одиночку, белое руководство НАСПЦН категорически отказалось финансировать деятельность второго Панафриканского конгресса, и пришлось изыскивать средства, чтобы можно было созвать этот конгресс и обеспечить его работу.
Значительные трудное!и создавались для Дюбуа и тем, что после войны резко активизировались в США антинегритянские элементы, один за другим следовали негритянские погромы, значительно участились случаи линчеваний, только в 1919 году было линчевано 70 негров. Дюбуа вынужден был тратить много сил и времени на борьбу с антинегритянскими выступлениями у себя на родине, что не позволяло ему уделять необходимого внимания международному негритянскому движению. Необходимо также учитывать и то, что в этот период Дюбуа вел упорную и очень тяжелую борьбу с Маркусом Гарви, вест-индским негром, развернувшим в США массовое движение негров под лозунгом: «Назад в Африку!»
На третьем Панафриканском конгрессе, который не был столь представительным, как предыдущие, выступали тем не менее многие деятели, пользовавшиеся широкой известностью. На лондонском заседании конгресса выступили Гарольд Ласки, Герберт Уэллс и сэр Сидней Оливье. Дал согласие выступить перед участниками конгресса лидер лейбористов Рамсей Макдональд, но его выступление не состоялось, так как началась избирательная кампания, следствием которой была победа на выборах лейбористов и создание первого лейбористского правительства.
Дюбуа и другие участники конгресса провели несколько встреч с представителями лейбористской партии, среди которых были Беатриса Уэбб, Клайне и другие. Вспоминая эти встречи, Дюбуа писал: «Мы подчеркивали значение классовой солидарности между белыми и черными рабочими в Англии, Америке и повсюду, однако наши доводы не произвели на лейбористов особого впечатления».
Из Лондона участники конгресса переехали в Париж, где прошла значительная часть работы третьего Панафриканского конгресса. Из столицы Франции группа делегатов конгресса во главе с Дюбуа направилась в Лиссабон для встречи с деятелями Африканской лиги, представлявшей африканские организации из португальских колоний Черного континента.