Воссозданный полк принял участие в десанте на Кубань (так называемом Улагаевском десанте) 14 августа – 7 сентября 1920 года. Целью десанта было привлечь на свою сторону кубанских казаков, по большей части сожалевших о конфликте с Белой армией и поднявших антисоветское вооруженное восстание. В случае успеха Врангель планировал отвоевать Кубань, а затем вернуться на Дон, где собирался вновь поднять на борьбу с большевиками донских казаков. Но Красная армия дала решительный отпор десанту. В частности, в боях целиком погиб 3-й (Гренадерский) батальон Алексеевского полка. Войска отряда генерала Улагая вернулись в Крым вместе с присоединившимися к ним кубанскими повстанцами.
В сентябре – октябре 1920 года Алексеевский полк участвовал в последнем наступлении войск генерала Врангеля, переименованных к тому времени в Русскую армию. Целью этого наступления было закрепиться в Северной Таврии и прорваться в глубь Украины. Но бои на Каховском плацдарме также закончились в пользу красных. Началось отступление Русской армии в Крым. Во время этого отступления в бою у с. Богдановка 28 октября 1920 года Алексеевский полк был разбит красными. Два батальона и учебная команда алексеевцев, укомплектованные преимущественно вчерашними красноармейцами, захваченными в плен во время десанта на Кубань, при приближении советской кавалерии сложили оружие. Из окружения вырвались только офицеры и добровольцы – всего чуть больше 40 человек.
Пленных алексеевцев, бывших красноармейцев, сотрудники ЧК после сортировки сразу же направили на пополнение советских войск. Судьба же офицеров сложилась трагически. Высшие офицеры были направлены в штаб Южного фронта на допрос, после которого расстреляны. Младшие офицеры – подпоручики и поручики – еще какое-то время жили надеждой на снисхождение. Их направили в Харьков – в распоряжение особого отдела Южного и Юго-Западного фронтов. Вскоре к алексеевцам присоединили взятых в плен в районе Перекопа офицеров Донского офицерского резервного и Сводно-стрелкового кавалерийского полков. Полтора месяца пленники содержались в харьковской тюрьме, так как их судьбу могли решить лишь всесильные «главные чекисты» Советской Украины – В.Н. Манцев и Е.Г. Евдокимов. Но те «работали» в Крыму: расстреливали людей, не пожелавших эвакуироваться с Русской армией Врангеля. Лишь по возвращении Манцева и Евдокимова в Харьков судьба 124 пленных офицеров была решена. Все они 9 декабря 1920 года были приговорены к расстрелу. Казнили пленников в течение суток после вынесения приговора. Среди расстрелянных было 42 офицера-алексеевца.
Выжившие в бою под с. Богдановкой алексеевцы под руководством полковника Бузуна добрались до кораблей и затем эвакуировались. Но другая довольно значительная группа военнослужащих полка не по своей воле осталась в Крыму и также была расстреляна чекистами. Речь идет о запасном батальоне, нестроевой роте, пулеметной команде, команде связи, а также – хозяйственной части, обозах 1-го и 2-го разрядов. Эту группу алексеевцев возглавлял полковник князь Гагарин.
В период отступления от Перекопа группа полковника Гагарина утратила связь с теми, кто оставался с Бузуном, и отстала от основных частей Русской армии. Пулеметная команда и команда связи покинули эту группу и направились в Феодосию. Но они либо не успели на посадку, либо не были взяты на корабли грузящимися там кубанскими казаками. Вскоре команды попали в плен, и их офицеры расстреляны органами ЧК.
13 ноября, когда полным ходом шла эвакуация в Севастополе, группа князя Гагарина находились в деревне Зуево – в 20 верстах от Симферополя. Вокруг были красные, и прорваться к Черному морю, за исключением дороги на Алушту, уже не представлялось возможным. Ночью в одном из домов деревни Зуево собрались офицеры-алексеевцы, чтобы принять решение о том, что делать дальше. Но единого мнения достичь не удалось. Одна часть алексеевцев решила попытать счастья в Алуште, другая – направиться в Джанкой и сдаться первой же красной части, третья – остаться в Зуево и ждать дальнейшего развития событий. Но никому не удалось выжить. Те, кто направился в Джанкой, были по большей части расстреляны там же специальным карательным отрядом ЧК. Алуштинская группа также была вскоре перехвачена красными, доставлена в Симферополь и там казнена. Те же, кто остался в Зуево, не зная о судьбе первых двух групп, вскоре решили пойти в Симферополь и сдаться на милость победителей.