Всего за время проведения операций с июля 1944 по 1 сентября 1945 года НКВД Белорусской ССР арестовало и задержало 97094 человек, в том числе, бандитов — 6514, бандпособников — 1036, участников антисоветских организаций — 651, немецких ставленников и другого антисоветского элемента — 6141, дезертиров и уклонявшихся от службы в Красной армии — 82752 человека. Убито 3282 бандита, дезертира и другого антисоветского элемента.
Кроме того, явилось с повинной 698 бандитов, 44 участника антисоветских организаций, 48188 дезертиров и уклонявшихся от мобилизации.
При проведении операций изъято: миномётов — 62, ПТР — 30, пулемётов — 657, автоматов — 1359, винтовок — 10485, револьверов — 771, гранат — 1435, мин — 1164, патронов — 34845, взрывчатых веществ — 893 кг, раций — 12, радиоприёмников — 51[78].
Террористические акты литовской, латвийской и эстонской контрреволюции послужили причиной депортации отдельных групп населения в восточные районы страны. Акты по переселению граждан из Прибалтики после её освобождения от фашистов продолжались до начала 1950-х годов.
В 1943 году в Литве представителями различных буржуазных партий был создан Верховный комитет освобождения Литвы, ставивший своей целью восстановление в Литве самостоятельного буржуазного государства.
13 августа 1944 года в связи с освобождением значительной части Литовской ССР президиум Верховного комитета освобождения Литвы принял решение перенести центр деятельности литовских националистов в Германию и Швецию.
Верховный комитет освобождения Литвы, находившийся в Берлине, принял на себя руководство подрывной деятельностью литовского национального подполья и при содействии военной разведки (абвера) перебросил в Литовскую ССР 25 своих эмиссаров-агентов с задачей сбора разведывательной информации для немецкой разведки и руководства деятельностью бандитских формирований и националистических организаций в Литве.
По состоянию на 19 марта 1945 года на территории Литовской ССР было проведено 2257 чекистско-войсковых операций. Ликвидированы 497 бандгрупп численностью 16983 человек, убито бандитов 5364 человек, захвачено — 10923, арестовано — 31 674, в том числе участников националистического подполья — 11412, задержано дезертиров, уклонившихся от службы в Красной армии — 33670, явилось с повинной — 9376. Изъято: орудий — 4, миномётов — 48, ПТР — 33, пулемётов станковых — 72, пулемётов ручных — 662, автоматов — 912, винтовок — 7606, револьверов и пистолетов — 1229, гранат — 6190, патронов — 1070410.
На имя И.В. Сталина 19 сентября 1945 года Л.П. Берия направил сообщение, в котором указывалось, что в дополнение к ранее представленной информации о ходе борьбы с антисоветским националистическим подпольем в Литве и его вооружёнными бандами НКВД СССР проведена следующая работа с 1 июля по 15 сентября 1945 года: ликвидировано бандгрупп — 256, убито бандитов — 3337, захвачено — 4388, арестовано участников подпольных организаций и иного антисоветского элемента — 7099, явились с повинной бандиты, находившиеся на нелегальном положении, дезертиры и уклонившиеся от призыва в Красную армию — 31 368. При этом у бандитов изъято следующее: пулемётов — 358, автоматов — 796, винтовок и пистолетов — 4046, гранат — 27 483, патронов — 544570. Кроме того, изъято: радиопередатчиков — 81, радиоприёмников — 123, пишущих машинок и других множительных аппаратов — 75, нелегальных типографий — 2[79].
После освобождения территории Литвы неоднократно предпринимались меры по выселению семей бандитов, бандпособников и кулаков.
Всего за 1945–1952 гг. были выселены из республики 29923 семьи — 108 364 человека. За этот период, кроме кулаков и членов их семей, выселялись члены семей осуждённых изменников родины, националистов, участников белоповстанческих и карательных отрядов, полицейских, немецких пособников, семьи действующих вооружённых бандитов, семьи осуждённых и ликвидированных бандитов, семьи действующих и осуждённых бандитских пособников.
При оформлении учётных дел для выселения учитывалась директива НКВД СССР и Прокуратуры СССР № 252 от 27 июня 1942 года о том, что не подлежали выселению семьи, имеющие близких родственников в рядах Красной армии, принимавших участие в партизанских отрядах, избранных в партийно-советские органы и награждённых орденами и медалями СССР.
Всего за 1941–1952 годы за пределы республики было выселено на спецпоселения 32 362 семьи, 120926 человек.
НКВД СССР 9 августа 1945 года доложило И.В. Сталину, В.М. Молотову и Г.М. Маленкову о проделанной работе по очистке Латвийской ССР от бандитского элемента и антисоветского националистического подполья. За период операций (с 22 июня 1944 по 1 августа 1945 года) было убито 672 бандита, задержано и арестовано 10285 человек, в том числе бандитов и бандпособников 2248 человек, изменников родины и предателей — 1376, разного антисоветского элемента — 321, дезертиров и уклонистов от призыва в армию — 6340.
