Однако (как того и требовало Фиванское жречество) Аменхотеп III, "жизнелюбивый сибарит" (А. Вейгалл), официально считал своим божественным отцом бога Амона-Ра, о чём свидетельствуют рельефы на стенах храма Амона в Луксоре, где рассказано, что мать Аменхотепа III Мутемуйю ночью посетил сам Амон-Ра. В сопроводительном тексте говорится: " Когда принял он [Амон-Ра] облик этого величества [Тутмоса IV]...нашёл он её [Мутемуйю], когда отдыхала она... (при встрече) сделав так, что она видела его в облике бога... и любовь к нему охватила члены её... И признёс слова перед ней Амон-Ра, Владыка престолов обеих Земель: Аменхотеп, властитель Фив - имя этого младенца, которого поместил я в тело твоё...Будет он царём...Будет править обеими Землями, подобно Ра, в вечности" (перевод В.В. Солкина).
Считается (В.В. Солкин, В.Н. Ларченко "Аменхотеп III: личность, эпоха и "стиль" цивилизации". 2005), что подобное стремление "ладить" с Фиванским жречеством обусловлено тем, что Аменхотеп III взошёл на престол в возрасте 8-10 лет, а в "Регентском совете", управляющем царством, который (совет) возглавляла вдовствующая царица Мутемуйя, верховный жрец Амона Птахмес, одновременно "визирь Юга", "начальник всех работ царя" и градоначальник Фив, обладал огромным влиянием (Аменхотепу III исполнилось 11 лет, когда его мать умерла и регентство, вероятно, прекратилось).
И тем не менее, юный фараон Аменхотеп III, по всей вероятности, испытывавший влияние взглядов отца (через мать), а также и своей исключительно умной и дальновид╛ной супруги Тийе (Аменхотеп III женился ко второму году правления) и её брата Аанена ("близкого к своему господину, любимого в доме царском"), верхового жреца храма Ра в Фивах (Южный Гелиополь), второго жреца Амона (надпись на его статуе), а также тестя и тёщи (Иуйя и Туйя), обладавших "огромным влиянием при дворе" (Н. Ривз), - тоже не слишком жаловал Фиванское жречество с их чрезмерными притязаниями на власть. Так, на десятом году своего царствования Аменхотеп III перенес в Фивы и обустроил культ гелиопольского бога Атона. Роскошная барка, в которой фараон Аменхотеп III вместе с царицей Тийе совершал увесели╛тельные прогулки, именовалась "Великолепие (бога) Атона (Сияние Йота)". Одному из своих воинских подразделений этот фараон присвоил имя Атона. В текстах из гробницы ╧ 46 в Фивах (эпоха правления Аменхотепа III) упоминается титул погребенного вельможи: "управляющий домом (хромом) Йота (Атона)" (96.c31), т.е. в Фивах при Аменхотепе III функционировал храм Атона.
Когда один из двух визирей Аменхотепа III - престарелый Птахмес, верховный жрец Амона, умер, то фараон Аменхотеп III через некоторое время назначил на этот высший пост простого царедворца, некоего Рамоса, которому и был дан титул "Глава жрецов ("надзирающий за жрецами") Верхнего и Нижнего Египта", обычно полагающийся жрецу высшего посвящения (А. Вейгалл "Эхнатон. Фараон - вероотступник". 1922). Примечательно (К. Жак "Нефертити и Эхнатон". 2006), что благодарный визирь Рамос был также и верным сторонником Эхнатона, который, воцарившись, не только подтвердил полномочия Рамоса, но даже и расширил сферу его служебной ответственности.
Таким образом, ещё дед и отец (а также близкие родственники) Эхнатона не испытывали особых симпатий к властолюбивым и корыстным жрецам Амона и открыто отдавали предпочтение солярному культу бога Атона (Ра-Горахти).
Представляется, что поскольку Тутмос IV причислен к фараонам XVIII династии, то его первой (главной) женой, в соответствии с утробным правом наследования трона, была дочь Аменхотепа II. Принцесса Мутемуйа, дочь царя хуррито-аккадской Митанни Артадамы I, как принято полагать, была матерью фараона Аменхотепа III. Одной из жён Аменхотепа III была также хурритка - Гилухена, дочь царя Митанни Сатарны (27.с64; 94.с289), взятая им на десятом голу правления. Когда в конце жизни Аменхотеп III долго и тяжело болел, царь Митанни Тушратта, сын Сатарны, прислал (с возвратом) фараону для исцеления статуэтку богини Иштар (Шавушка) - личной и родовой богини (иштари) мужчин дома митанийских царей (с индоарийскими корнями). В сопроводительном письме Тушратта пишет (Амарнский архив): "Иштар для меня - моя богиня", но "для моего брата (Аменхотепа III) она - не его божество" (поскольку у египтян линия родства определялась по отцовской линии). Однако у хурритов ещё были сильны матриархальные представления (материнская линия родства) и Тушратта, по-видимому, надеялся, что Иштар поможет своему чаду по материнской линии. И когда фараон Аменхоте╛п III скончался, царь Тушратта искренне расстроился, скорбел, как по кровному родственнику: "Плакал я всякий день. Ночью вставал, не ел и не пил, все от тоски" (соболезнование, отправленное в Египет). В свою очередь, царь Тушратта отдал свою дочь Тадухепу (Тадухену) в жёны Аменхотепу IV Эхнатону (А. Вейгалл "Эхнатон. Фараон - вероотступник". 1922) перед 36 годом правления Аменхо-тепа III.