1935, 2 марта – выступил с докладом «Крылатая ракета для полета человека» на I Всесоюзной конференции по применению ракетных аппаратов для исследования стратосферы.
1935 – на XI планерные состязания представлен планер СК-9 – «двухместный планер для дальних буксировочных перелетов и полетов на дальность вдоль грозового фронта».
1935, 10 апреля – родилась дочь С.П. Королева и К.М. Винцентини – Наталья.
1936, 9 мая – испытания крылатой ракеты 216.
1936 – разработал проект ракетоплана 218(318).
1936, 16 июня – техсоветом РНИИ работа над ракетопланом РП-218-1(318) была принята на заседании как сверхплановая.
1938 – проводил стендовые испытания крылатой ракеты 212: 29 мая 1938 года в результате взрыва получил ранение.
1938, ночь на 28 июня – С.П. Королев арестован по ложному обвинению в том, что состоял членом антисоветской контрреволюционной организации: ст. 58, пп. 7 и 11 Уголовного кодекса РСФСР.
1938 – осужден Военной коллегией Верховного суда СССР по ст. 58 (пп. 7, 8) УК РФ на 10 лет лишения свободы с конфискацией личного имущества и поражением в политических правах на 5 лет.
1939, август – ноябрь – отбывал наказание в лагере прииска Мальдяк (Дальний Восток).
1939 – разработанная и построенная С.П. Королевым (совместно с Щетинковым Е.С.) крылатая ракета 212 успешно прошла испытания.
1940, 28 февраля – состоялся первый полет ракетоплана конструкции С.П. Королева (летчик В.П. Федоров).
1940 – переведен в Особое техническое бюро при Наркомате внутренних дел СССР – ЦКБ-29.
1941, июль – эвакуирован вместе с конструкторским коллективом А.Н. Туполева (ЦКБ-29) в Омск, на завод № 156.
1941–1942, декабрь – работал в спецподразделении НКВД в Омске, где завершил проект реактивного перехватчика с реактивным двигателем РД-1 конструкции В.П. Глушко.
1942 – переведен в спецподразделение НКВД в Казань. Являлся заместителем руководителя КБ Глушко В.П.
1943, февраль – начал работы по реактивной установке (РУ) для самолета Пе-2.
1944 – руководил разработкой и испытанием в полетах жидкостных ракетных двигателей РД-1 и РД-3 на самолетах конструкции С.А. Лавочкина.
1944 – принимал участие в разработке ракетного снаряда Д-2, созданного на основе ракет 217/2I, испытания которых велись в РНИИ (1935–1936).
1944, 27 июля – подписано постановление Президиума Верховного Совета СССР об освобождении С.П. Королева (на основании докладной записки за подписью Л.П. Берии о целесообразности досрочного освобождения со снятием судимости особо ценных специалистов).
1944, 10 августа – освобожден из-под стражи.