Полевые управления тринадцати стрелковых корпусов и 45 стрелковых дивизий подлежали расформированию. Днепровская флотилия поступала в оперативное подчинение Главнокомандующего советскими оккупационными войсками в Германии.
Общая численность личного состава Группы советских оккупационных войск в Германии с самого начала составляла 380 тысяч человек. Командование Группы разместилось в Вюнсдорфе под Берлином.
Соответствующие преобразования происходили с советскими войсками и в других бывших фронтовых объединениях, из которых также создавались группы войск.
С первых дней существования Группы советских оккупационных войск в Германии серьезное внимание командование группы и Военный совет уделяли вопросам укрепления дисциплины и правопорядка в войсках. Переход с военных на мирные рельсы в жизни войск — процесс достаточно сложный, и не в последнюю очередь психологически. В случае с ГСОВГ эта проблема приобретала отчетливое политическое значение: советские войска в Германии были на самых передовых рубежах формировавшейся системы социализма в Восточной Европе. Они были своеобразной «визитной карточкой советской военной мощи».
Исходя из указаний Москвы и понимая необходимость наведения образцового порядка в войсках, маршал Жуков принимает ряд очень жестких мер, которые даже вызвали нарекания со стороны Сталина.
20 сентября 1945 года И. Сталин направил в Берлин указание об отмене системы огульного наказания командного состава за проступки отдельных военнослужащих:
«Я случайно узнал вчера от СМЕРШ, что Военный совет Группы советских оккупационных войск в Германии издал приказ от 9 сентября с.г., где он, отмечая мародерские действия отдельных военнослужащих, считает необходимым наказать весь командный состав от сержантов и офицеров до командиров рот включительно путем перевода офицерского состава до командиров рот включительно на казарменное положение, с тем чтобы командиры были расположены вместе с подчиненными с обязательством командирам взводов и командирам рот постоянно находиться со своими подчиненными.
Как оказалось, копия этого приказа не была послана в Генеральный штаб.
Я считаю этот приказ неправильным и вредным. Он неправилен ввиду его огульного характера и несправедливости, так как из-за мародерских действий отдельных военнослужащих огульно и несправедливо наказывается весь командный состав до командиров рот включительно. Он вреден, так как он не укрепляет дисциплину, а, наоборот, ломает ее, дискредитируя командный состав в глазах рядовых. Я уже не говорю о том, что, если этот приказ попадет в руки руководителей иностранных армий, они не преминут объявить Красную Армию армией мародеров.
Прошу Вас немедленно отменить этот приказ. Найдите форму для отмены приказа, которая бы не набрасывала тень на командование группы. Я не пишу Вам формального приказа Ставки об отмене Вашего приказа, чтобы не ставить Вас в неловкое положение, но я требую, чтобы:
1. Приказ был отменен немедленно с донесением об этом в Генеральный штаб;
2. Подобные приказы, имеющие серьезный характер, не издавались впредь без предварительного сообщения в Ставку о Ваших соображениях;
