Третьим соображением была убежденность Родса в необходимости единой "туземной" политики для всех республик. В бурских республиках Трансвааль и Оранжевое свободное государство чернокожие африканцы не имели избирательных прав, и Родс поддержал предложения ограничить голоса чернокожих и в Капской колонии. Вначале он начал проводить политику, которая лишала права голоса тех, кто владел землей в общине, - этот шаг снискал ему политическую благосклонность многих его бурских избирателей. "Мы должны управлять туземцами как подвластной расой", - объявил он. "По данным последней переписи населения [возможно, около 1890 года], в колонии насчитывается 1 250 000 туземцев и 250 000 европейцев. При нынешнем избирательном праве, если бы они им воспользовались, туземцы имели бы большинство голосов". Он продолжил: "Обращайтесь с туземцами как с подвластным народом до тех пор, пока они остаются в состоянии варварства".
Родс постоянно работал над созданием союза южноафриканских республик, и он знал, что относительно либеральная политика Капской колонии в отношении чернокожих африканцев всегда будет главным камнем преткновения на пути к объединению с бурскими республиками. Поэтому он начал работать над изменением законов в Капской колонии, поддержав закон о легализации порки непочтительных (чернокожих) слуг; голосование, чтобы снова повысить требования к владению собственностью для участия в выборах; введение теста на образование, что лишило права голоса еще тысячи чернокожих избирателей; насильственное присоединение новых туземных земель и переселение тысяч чернокожих африканцев в резервации. "Моя идея заключается в том, что туземцев следует держать в этих туземных резервациях и вообще не смешивать с белыми людьми", - заявил он. Он принял законы, по которым фермы становились неразделимыми, что означало, что младшие сыновья и незамужние дочери фермеров вынуждены были покидать землю, обеспечивая приток дешевой рабочей силы. Не успокоившись на этом, Родс ликвидировал миссионерские школы, чтобы чернокожие африканцы не могли получить образование. "Когда я вижу проблемы с рабочей силой, которые происходят в Соединенных Штатах, - заметил он, - и когда я вижу проблемы, которые будут происходить с английским народом в их собственной стране... я скорее рад, что рабочий вопрос здесь связан с туземным вопросом... Если белые сохранят свое положение высшей расы, наступит день, когда мы все будем благодарны за то, что туземцы находятся с нами на своем месте". Он ввел комендантский час для чернокожих африканцев и расовую сегрегацию в государственных учреждениях.
Все эти изменения поддерживались газетами Родса, особенно "Кейп Аргус". К 1895 году он, по сути, создал все ключевые основы режима апартеида, который полностью вступит в силу полвека спустя. А в Родезии Земельная комиссия Родса лишила коренных жителей их земель и поместила в плохо расположенные резервации, чтобы их территории могли быть открыты для белых поселенцев.
Однако даже Сесил Родс не был непобедим. Его падение было стремительным и произошло по его собственной вине. Его здоровье ухудшалось. Он страдал от проблем с сердцем, которые усугублялись курением, выпивкой и значительным набором веса. Ему было всего около сорока, но выглядел и вел он себя гораздо старше. Ему стало казаться, что времени на осуществление одной из самых больших своих амбиций - объединение всех независимых республик юга Африки под одним знаменем - остается все меньше. Пока что перспективы добычи полезных ископаемых в Родезии складывались не так, как он надеялся. После длительной поездки по региону один из его горных инженеров сообщил: "Я призываю инвестирующую общественность проявлять должную дискриминацию". Оказалось, что большие залежи золота в Трансваале, в окрестностях Йоханнесбурга, не простираются на север, как многие предполагали. Родезия и Британская южноафриканская компания не только не оправдали прежних оптимистичных прогнозов о невероятном богатстве недр, но и великие золотые месторождения Трансвааля привели к тому, что бурская республика стала самым богатым государством на юге Африки - что навсегда помешало бы ее объединению с Капской колонией. Кроме того, Родс испытывал личную ненависть к Паулю Крюгеру, президенту Трансвааля, и стал участником плана по вторжению в Бурскую республику, свержению ее президента и насильственному присоединению к Капской колонии.
