26 февраля Горбачев принял в Кремле Зория Балаяна и Сильву Капутикян. Генсек заявил, что события в Карабахе это – «удар нам в спину. С трудом приходится сдерживать азербайджанцев, а главное – создается опасный прецедент. В стране несколько десятков потенциальных очагов противостояния на этнической почве, и пример Карабаха может толкнуть на безрассудство тех, кто пока не рискует прибегать к насильственным средствам». Горбачев отверг идею передачи Нагорного Карабаха Армении, но пообещал провести в регионе реформы в области культуры и экономики.[103] Со своей стороны, Балаян и Капутикян согласились обратиться к людям на Театральной площади Еревана с призывом приостановить демонстрации на месяц.
Вечером 27 февраля в телевизионном интервью заместителя генерального прокурора СССР Александра Катусева прозвучала информация о том, что в столкновении близ Аскерана 22 февраля погибли два азербайджанца. По одной из версий, эта информация могла спровоцировать армянский погром в Сумгаите 27–29 февраля, в ходе которого, по официальным данным, погибли 26 армян и 6 азербайджанцев. В погроме активную роль играли азербайджанские беженцы из Армении. После этих событий почти все армяне за пределами НКАО покинули Азербайджан, а почти все азербайджанцы – Армению. В НКАО, особенно в Степанакерте, почти ежедневно проходили многолюдные митинги.
В марте 1988 года Михаил Горбачев исключил возможность любых изменений границ между республиками и объявил о материальной помощи НКАО. 15 июня 1988 года Верховный Совет Армянской ССР дал согласие на вхождение НКАО в состав Армянской ССР и обратился в связи с этим к Верховному Совету Азербайджанской ССР. Но в Баку ответили, что вопрос о территориальной принадлежности Нагорного Карабаха должны решать только власти Азербайджана, а не Армении.[104]
В январе 1989 года Москва ввела прямое правление в Нагорном Карабахе, которое продолжалось до ноября 1989 года, но не привело к разрядке напряженности. В июне – июле 1989 года в Баку начались массовые демонстрации. В июле образовался народный фронт Азербайджана, который уже осенью под лозунгами сохранения Карабаха в составе Азербайджана устраивал столь же многолюдные демонстрации в Баку и других азербайджанских городах, как и Карабахское движение в Армении. Народный фронт критиковал коммунистическое правительство Азербайджана за неспособность обеспечить территориальную целостность республики.
В августе 1989 года, после того как Армения ввела блокаду Нахичеванской АССР, Азербайджан начал блокировать железнодорожное сообщение с Арменией и Нагорным Карабахом. В сентябре 1989 года Верховный Совет Азербайджанской ССР принял конституционный закон, разрешивший республике учреждать и упразднять автономные образования на своей территории. Тогда же в Азербайджане был упразднен Шаумяновский район, населенный преимущественно армянами. 1 декабря 1989 года Верховный Совет Армении, вопреки позиции Москвы, совместно с Национальным советом Нагорного Карабаха (неконституционным органом, образованным Съездом полномочных представителей Нагорного Карабаха), «основываясь на общечеловеческих принципах самоопределения наций и отзываясь на законное стремление к воссоединению двух насильственно разделенных частей армянского народа» приняли постановление «О воссоединении Армянской ССР и Народного Карабаха».[105] Это постановление было отвергнуто Азербайджаном. В 1990‐е годы армяно-азербайджанское противостояние из-за Нагорного Карабаха продолжилось. В апреле 1991 года начались масштабные вооруженные столкновения на территории Карабаха, которые в 1992 году переросли в полномасштабную армяно-азербайджанскую (первую Карабахскую) войну, завершившуюся в 1994 году победой Армении и непризнанной Нагорно-Карабахской Республики (НКР), оккупировавших также территорию семи районов Азербайджана. В ходе второй Карабахской войны (2020, 2023) Азербайджан восстановил контроль над Нагорным Карабахом. НКР прекратила свое существование с 1 января 2024 года, и все армянское население Нагорного Карабаха эмигрировало в Армению.
