Сафие-султан обладала абсолютной властью в империи. Она назначала любого человека на любую должность. Кто давал ей больше взятки, тот и получал более высокий пост. Нормы и этические принципы, установленные в империи султаном Сулейманом, к этому времени утратили свою силу. Взятки она получала при посредничестве евнуха-привратника Газанфер-аги, охранника невольниц Осман-аги, Разие-хатун и представительницы европейской диаспоры Эстен Киры.
Через последнюю Сафие-султан установила контакт с послом Венеции и брала взятки при взимании пошлин. В 1600 году она поручила Кире организовать чеканку неполновесных, обесцененных монет, чтобы заплатить янычарам. Те вскоре поняли, что монеты фальшивые. Начался бунт. Виновницей солдаты считали Киру. Разозленная солдатня убила Киру и ее сына, между тем как Сафие удалось остаться в стороне. Она действовала так осторожно и умело, что всегда ускользала от ответственности. Через несколько лет янычары снова взбунтовались и убили Газанфер-агу и Осман-агу. Сафие-султан потеряла еще двух сообщников, но продолжала обводить своего сына Мехмеда III вокруг пальца.
Народ в Анатолии попал под власть жестоких правителей, которые получали должности исключительно благодаря взяткам. Никто больше не хотел мириться с ситуацией, сложившейся в стране. Люди говорили, что им больше нечего отдавать, кроме своих жизней. В Анатолии поднялось восстание. Это крестьянское движение получило в турецких источниках название «джелялийская смута». Мехмед III посылал одну армию за другой против повстанцев, но войска терпели поражение. Его 21-летний сын Махмуд попросил у отца разрешения отправиться с войсками для подавления восстания в Анатолии. Он сказал: «Отец, назначь меня главнокомандующим, и я подавлю бунт в Анатолии». Однако Сафие убедила мужа в том, что сын таким образом стремится занять трон: победа открыла бы ему путь к султанской власти. Все знали, что Махмуд III не делал ни шагу без одобрения матери. Однажды ночью, когда принц Махмуд спал, палачи султана удавили его.
Тем временем Сафие-султан начала сооружение Ени Джами (мечети Ени) и Эминеню, но народ не поддерживал ее начинание, потому что все знали, что строительство мечети финансируется за счет взяток.
13-летний период слабой султанской власти завершился со смертью в 1603 году 37-летнего Мехмеда III. Ему наследовал его внук Ахмед, немедленно отославший Сафие-султан в старый дворец. Пробыв там два года, она умерла в 1605 году и была похоронена в гробнице своего мужа в мечети Ая-София.
Ахмед I был еще ребенком, когда взошел на престол в начале XVII века. Как мы уже говорили, он отослал Сафие-султан в старый дворец и присвоил своей матери Хандан-султан статус валиде.